r - 如何将表函数应用于向量列表？

Question

我是 R 的新手，我有以下代码:

Permutation<-function(sequence,k)
{ 
   List <- list() 
   numberkmers <-length(sequence)-k+1
   for (i in 1:numberkmers)
   { 
    j <-i+k-1 
    kmer <- sequence[i:j]
    kmertmp <- sequence[i:j]
    kmer <-sort(kmer)
    perlist <-c()
    for (l in 1:k)
    {
      index <- which(kmer==kmertmp[l])
      perlist <- c(perlist,index)
    } 
   List[[i]] <- perlist
  }
  return(List)
} 
sequence <- qnorm(runif(1000),100,15) 
ListPer <- Permutation(sequence,4)

此代码根据序列中 k 个数字的顺序生成排列，即如果序列是 {39,12,40,18,20} 和 k=4 那么根据 39,12,40,20 的排序顺序，第一个排列是 3,1,4,2 ..

我有两个问题:

1. ListPer 是序列中发生的所有排列(即向量)的列表，我想将表函数应用于列表中的所有排列，因此最终结果将是:

   P   : occur
   

   1,2,3,4: 34

   2,3,4,1: 25

   2,1,3,4: 15

2. 结果表是否用作查找表，以便我可以为任何统计分析检索一个排列的出现次数。

非常感谢

Answer 1

您有一些使用 table() 的选项。您可以连接这些值并进行计数

tt<-table(sapply(ListPer, paste, collapse=":"))
tt["2:1:4:3"]
# [1] 33

或者您可以创建一个 4D 计数数组

tt<-table(data.frame(do.call(rbind, ListPer)))

然后你可以用

算出

tt["2","1","4","3"]
# [1] 33

请注意，这些是字符，因为“表”索引结果是字符向量