java - 治愈和预防 gephi 不稳定的提示和技巧？

Question

在我的 gephi 安装提示内存不足并尝试自行重置内存限制后，我遇到了严重的不可靠性。这不起作用，虚拟机也无法启动，所以我手动将内存重置为 1024，这不起作用，然后通过编辑通过开始菜单访问的配置文件将内存重置为 512。

该系统现在非常不可靠。每次我尝试使用它时都会卡住和崩溃。我尝试放弃我的项目(不是很大 - 11k 节点)，以防项目文件损坏，并尝试往返检查点，从“以防万一发生灾难”csv 将边缘和节点列表读入空白项目我做了边缘和节点列表导出。它可以正常读取节点列表，但无法读取边缘列表并再次卡住。该日志文件包含大量有关已弃用的 netbeans 用法的警告，以及有关 java 数组索引越界的最终“严重”警告。对我来说，这听起来我无能为力……但希望是永恒的。

除了全部清除并重新安装之外，是否有任何人可以提供任何实用技巧来帮助保持 gephi 的快乐？

我使用的是 XP SP3，具有最新的 Java、双核和 2 GB RAM。

我编辑的配置文件与日志文件消息位于不同的系统路径上。配置文件是通用路径，日志文件是特定于我作为用户的。我认为这是我从文档中可以看出的，但可能是可疑的。我想知道我的内存限额重置是否实际上并未正确生效。但除了通过配置之外，我不知道如何检查它。

我真的真的真的很喜欢Gephi - 当它工作正常时。 (但是为了做我今天需要做的事情，我需要回到 R...)

谢谢!

Answer 1

当你内存绝对不足时的一些提示:- 最小化节点和边的属性数量。理想情况下，你什么都没有。- 微调 Gephi RAM 设置。 Gephi installation page说:

On computers with 2GB of memory, you can set -Xmx1400 to get maximum performance.

如果 1024 对于您的机器来说太高，而 512 太低，请尝试中间值？当然，杀死机器上运行的任何不必要的进程。