r - fread 无法读取第一列为空的 .csv 文件

Question

假设我有第一个 test.csv，如下所示

,a,b,c,d,e

如果我尝试使用 read.csv 读取它，它工作正常。

read.csv("test.csv",header=FALSE)
#  V1 V2 V3 V4 V5 V6
#1 NA  a  b  c  d  e
#Warning message:
#In read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  :
#  incomplete final line found by readTableHeader on 'test.csv'

但是，如果我尝试使用 fread 读取此文件，则会收到错误。

require(data.table)
fread("test.csv",header=FALSE)
#Error in fread("test.csv", header = FALSE) : 
#  Not positioned correctly after testing format of header row. ch=','

为什么会发生这种情况？我可以采取什么措施来纠正这种情况？

Answer 1

对于我来说，我的问题只是第一个？我的文件的行缺少 ID 值。

因此，我能够通过将 autostart 指定到文件中足够远的位置来弹出非缺失值来解决问题:

fread("test.csv", autostart = 100L, skip = "A")

这保证了当 fread 尝试自动识别 sep 和 sep2 时，它会在文件中格式正确的位置执行此操作。

指定 skip 还可以确保 fread 找到作为列名称基础的正确行。

如果第一个字段确实没有非缺失值，那么您最好使用 Richard Scriven 的方法或在您喜欢的文本编辑器中进行查找和替换，从 .csv 中删除该字段。