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例如通过运行:
snakemake -p --use-conda -j 16 --snakefile ../../Snakefile --configfile pipeline-test.config.yaml
特别是我希望获得 snakefile 中可用核心的数量，以便能够使用该值执行一些计算。
最佳答案
您可以在snakefile 中使用sys.argv 来解析命令行参数。
关于snakemake - 从 snakefile 中的命令行获取实际的 --cores [N], --jobs [N], -j [N] 值，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/54870684/
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我是一名优秀的程序员,十分优秀！