- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我正在尝试创建前两个主要成分的分数图。我首先根据 class
将数据分成三个数据框。然后我转换数据并执行 PCA。
我的数据如下:
14 1 82.0 12.80 7.60 1070 105 400
14 1 82.0 11.00 9.00 830 145 402
14 1 223.6 17.90 10.35 2200 135 500
15 1 164.0 14.50 9.80 1946 138 500
15 1 119.0 12.90 7.90 1190 140 400
15 1 74.5 7.50 6.30 653 177 350
15 1 74.5 11.13 8.28 930 113 402
16 1 279.5 14.30 9.40 1575 230 700
16 1 82.0 7.80 6.70 676 175 525
16 1 67.0 11.00 8.30 920 106 300
16 2 112.0 11.70 8.00 1353 140 560
16 2 149.0 12.80 8.70 1550 170 550
16 2 119.0 8.50 7.40 888 175 250
16 2 119.0 13.30 9.60 1275 157 450
16 2 238.5 14.90 8.90 1537 183 700
16 2 205.0 12.00 7.90 1292 201 600
16 2 82.0 9.40 6.20 611 209 175
16 2 119.0 15.95 10.25 1350 145 450
16 2 194.0 16.74 10.77 1700 120 450
17 2 336.0 22.20 10.90 3312 135 450
17 3 558.9 23.40 12.60 4920 152 600
17 3 287.0 14.30 9.40 1510 176 800
17 3 388.0 23.72 11.86 3625 140 500
17 3 164.0 11.90 9.80 900 190 600
17 3 194.0 14.40 9.20 1665 175 600
17 3 194.0 14.40 8.90 1640 175 600
17 3 186.3 9.70 8.00 1081 205 600
17 3 119.0 8.00 6.50 625 196 400
17 3 119.0 9.40 6.95 932 165 250
17 3 89.4 14.55 9.83 1378 146 400
第 1 列:type
,第 2 列:class
,第 3 列:v1
,第 4 列:v2
, 第 5 列:v3
,第 6 列:v4
,第 7 列:v5
,第 8 列:v6
我的代码如下:
data <- read.csv("data.csv")
result <- split(data, data$class);
data1 <- result[[1]][,3:8];
data1Logged <- log10(data1)
pca.data1Logged = prcomp( ~ v1 +
v2 +
v3 +
v4 +
v5 +
v6,
data = data1Logged, scale. = FALSE );
data2 <- result[[2]][,3:8];
data2Logged <- log10(data2)
pca.data2Logged = prcomp( ~ v1 +
v2 +
v3 +
v4 +
v5 +
v6,
data = data2Logged, scale. = FALSE );
data3 <- result[[3]][,3:8];
data3Logged <- log10(data3)
pca.data3Logged = prcomp( ~ v1 +
v2 +
v3 +
v4 +
v5 +
v6,
data = data3Logged, scale. = FALSE );
对于三个 class
中的每一个,我都想要 PC1 和 PC2 的分数图:
pca.data1Logged$x[,1:2]
pca.data2Logged$x[,1:2]
pca.data3Logged$x[,1:2]
这是我能想到的最好的:
opar <- par(mfrow = c(1,3))
plot(pca.data1Logged$x[,1:2])
plot(pca.data2Logged$x[,1:2])
plot(pca.data3Logged$x[,1:2])
par(opar)
但我希望对这个图进行缩放、着色、叠加等操作。我已经开始阅读有关 ggplot 的内容,但我没有这样做的经验。我想要如下内容:
https://cran.r-project.org/web/packages/ggfortify/vignettes/plot_pca.html
上面的问题是我将数据分成了 3 个单独的数据框,因此没有“class1”、“class2”、“class3”的标题。
最佳答案
您可以使用 factoextra
和 FactoMineR
之类的
library("factoextra")
library("FactoMineR")
#PCA analysis
df.pca <- PCA(df[,-c(1,2)], graph = T)
# Visualize
# Use habillage to specify groups for coloring
fviz_pca_ind(df.pca,
label = "none", # hide individual labels
habillage = as.factor(df$class), # color by groups
palette = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"),
addEllipses = TRUE # Concentration ellipses, legend.title = "Class")
您可以手动将 Dim1 和 2 更改为 PC1 和 2。为此,您可以从此图中记下“Dim1 (63.9%)”和“Dim2 (23.3%)”的值,并使用以下代码将 Dim1 和 2 更改为 PC1 和 2,如
fviz_pca_ind(df.pca,
label = "none", # hide individual labels
habillage = as.factor(df$class), # color by groups
palette = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"),
addEllipses = TRUE, # Concentration ellipses
xlab = "PC1 (63.9%)", ylab = "PC2 (23.3%)", legend.title = "Class")
如果你想对数据进行日志转换,那么你可以使用
df[,3:8] <- log10(df[,3:8])
df.pca <- PCA(df, graph = T)
fviz_pca_ind(df.pca,
label = "none", # hide individual labels
habillage = as.factor(df$class), # color by groups
palette = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"),
addEllipses = TRUE, # Concentration ellipses
legend.title = "Class")
要手动将 Dim1 和 2 更改为 PC1 和 2,可以使用以下代码
fviz_pca_ind(df.pca,
label = "none", # hide individual labels
habillage = as.factor(df$class), # color by groups
palette = c("#00AFBB", "#E7B800", "#FC4E07"),
addEllipses = TRUE, # Concentration ellipses
xlab = "PC1 (64.9%)", ylab = "PC2 (22.6%)", legend.title = "Class")
数据
df =
structure(list(Type = c(14L, 14L, 14L, 15L, 15L, 15L, 15L, 16L,
16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 17L, 17L,
17L, 17L, 17L, 17L, 17L, 17L, 17L, 17L, 17L), class = c(1L, 1L,
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L,
2L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L), v1 = c(82, 82,
223.6, 164, 119, 74.5, 74.5, 279.5, 82, 67, 112, 149, 119, 119,
238.5, 205, 82, 119, 194, 336, 558.9, 287, 388, 164, 194, 194,
186.3, 119, 119, 89.4), v2 = c(12.8, 11, 17.9, 14.5, 12.9, 7.5,
11.13, 14.3, 7.8, 11, 11.7, 12.8, 8.5, 13.3, 14.9, 12, 9.4, 15.95,
16.74, 22.2, 23.4, 14.3, 23.72, 11.9, 14.4, 14.4, 9.7, 8, 9.4,
14.55), v3 = c(7.6, 9, 10.35, 9.8, 7.9, 6.3, 8.28, 9.4, 6.7,
8.3, 8, 8.7, 7.4, 9.6, 8.9, 7.9, 6.2, 10.25, 10.77, 10.9, 12.6,
9.4, 11.86, 9.8, 9.2, 8.9, 8, 6.5, 6.95, 9.83), v4 = c(1070L,
830L, 2200L, 1946L, 1190L, 653L, 930L, 1575L, 676L, 920L, 1353L,
1550L, 888L, 1275L, 1537L, 1292L, 611L, 1350L, 1700L, 3312L,
4920L, 1510L, 3625L, 900L, 1665L, 1640L, 1081L, 625L, 932L, 1378L
), v5 = c(105L, 145L, 135L, 138L, 140L, 177L, 113L, 230L, 175L,
106L, 140L, 170L, 175L, 157L, 183L, 201L, 209L, 145L, 120L, 135L,
152L, 176L, 140L, 190L, 175L, 175L, 205L, 196L, 165L, 146L),
v6 = c(400L, 402L, 500L, 500L, 400L, 350L, 402L, 700L, 525L,
300L, 560L, 550L, 250L, 450L, 700L, 600L, 175L, 450L, 450L,
450L, 600L, 800L, 500L, 600L, 600L, 600L, 600L, 400L, 250L,
400L)), class = "data.frame", row.names = c(NA, -30L))
关于r - 使用主成分构建分数图,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/63462344/
直接从 Python 代码运行 pylint 时,我似乎无法获得任何返回值。从命令行运行它会生成一个漂亮的报告,在底部有一个总结分数。 我已经尝试将“Run”的返回值放入一个变量中,并获取它的“rep
我是 Python 新手,正在尝试学习单词检测。我有一个带有单词的数据框 sharina['transcript'] Out[25]: 0 thank you for calling my
http://jsfiddle.net/q8P7Y/ 我在最后显示最终分数时遇到问题,有很多方法可以做到这一点,但我不确定什么是最好的。 正如你所看到的,下一个按钮只是 div 的显示/隐藏,而不是页
我使用滑动 slider 并有计数器分数。它计数很好,但我需要计数 =(所有幻灯片 - 1)。例如,如果我有 20 张幻灯片,我想显示总数 19。有什么办法可以做到这一点吗?我使用他们网站上的常规 j
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我试图在按下按钮时添加分数,分数显示在 JTextField 中,但是当按下按钮时,分数会添加,它显示为 0。我有一个存储分数的整数字段 private int score=0; yesButton
我可以在选项(单选按钮)随机播放之前计算分数/分数,如下面的代码所示。在Collection.shuffle()之前,选项是固定的,因为 CorrectChoice将始终分配给c2单选按钮。那么我可以
我在这里的代码只能得到87%的代码,因为“带有非正参数的加法参数什么也没做。我该如何解决呢?我尝试了更多的方法,但是我什至无法解决此错误在同学的帮助下 说明是: 对于此分配,您将创建一个存储分数的类。
昨天,我尝试以一种方式执行此操作...今天我尝试另一种方式,但仍然卡住了。我必须找到一种使用整数除法和取模来做到这一点的方法。这是我的代码,后面是错误消息。 public int evaluateFr
我这里有一些特殊字符: http://209.141.56.244/test/char.php 但是当我在这里通过 ajax 抓取这个文件时,它们显示为 back ?标记: http://209.14
我得到了一张图表 G与 n顶点,标记自 1至 n (2 a_1 -> a_2 -> ... a_k -> n A然后将占据 1 的所有“子节点”节点, a_1 , ... a_x (其中 x = ce
我有一个看起来像这样的 mongodb 集合: db.scores.insert({"name": "Bob", value: 96.3, timeStamp:'2010-9-27 9:32:00'}
我试图更好地了解 lucene 如何对我的搜索进行评分,以便我可以对我的搜索配置或文档内容进行必要的调整。 以下是分数明细的一部分。 产品: 0.34472802 = queryWeight,
在我网站上用户生成的帖子下,我有一个类似亚马逊的评级系统: Was this review helpful to you: Yes | No 如果有投票,我会在该行上方显示结果,如下所示:
对于我的项目,我需要找出哪些搜索结果被视为“良好”匹配。目前,分数因查询而异,因此需要以某种方式对它们进行标准化。标准化分数将允许选择高于给定阈值的结果。 我为 Lucene 找到了几个解决方案: h
我有一个由 57 个变量组成的数据文件。由于测量水平不均匀,我想将其中的大约 12 个转换为 z 分数。我查找了互联网资源和帮助文件。一个互联网资源建议我需要 Rbasic 包(不存在)。我使用了 s
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我是一名优秀的程序员,十分优秀!