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R 在动物园对象和数据框之间进行转换,不同列数的结果不一致?

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-02 02:29:36 26 4
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我在数据框和动物园对象之间切换时遇到困难,特别是保持有意义的列名称,以及单变量和多变量情况之间的不一致:

library(zoo)

#sample data, two species counts over time
t = as.Date(c("2012-01-01", "2012-01-02", "2012-01-03", "2012-01-04"))
n1 = c(4, 5, 9, 7) #counts of Lepisma saccharina
n2 = c(2, 6, 0, 11) #counts of Thermobia domestica
df = data.frame(t, n1, n2)
colnames(df) <- c("Date", "Lepisma saccharina", "Thermobia domestica")

#converting to zoo loses column names in univariate case...
> z1 <- read.zoo(df[,1:2]) #time series for L. saccharina
> colnames(z1)
NULL
> colnames(z1) <- c("Lepisma saccharina") #can't even set column name manually
Error in `colnames<-`(`*tmp*`, value = "Lepisma saccharina") :
attempt to set colnames on object with less than two dimensions
#... but not in multivariate case
> z2 <- read.zoo(df) #time series for both species
> colnames(z2)
[1] "Lepisma saccharina" "Thermobia domestica"

要从动物园对象返回到原始格式的数据框,仅使用 as.data.frame 是不够的,因为它不包含日期列(日期最终为在行名中):需要做更多的工作。

zooToDf <- function(z) {
df <- as.data.frame(z)
df$Date <- time(z) #create a Date column
rownames(df) <- NULL #so row names not filled with dates
df <- df[,c(ncol(df), 1:(ncol(df)-1))] #reorder columns so Date first
return(df)
}

这在多变量情况下效果很好,但显然无法在单变量情况下恢复有意义的列名称:

> df2b <- zooToDf(z2)
> df2b
Date Lepisma saccharina Thermobia domestica
1 2012-01-01 4 2
2 2012-01-02 5 6
3 2012-01-03 9 0
4 2012-01-04 7 11

> df1b <- zooToDf(z1)
> df1b
Date z
1 2012-01-01 4
2 2012-01-02 5
3 2012-01-03 9
4 2012-01-04 7

有没有一种简单的方法可以处理两者单变量多变量情况?看来 z1 需要以某种方式记住列名。

最佳答案

如果您不想删除维度,请使用drop=FALSE:

R> (z1 <- read.zoo(df[,1:2], drop=FALSE))
Lepisma saccharina
2012-01-01 4
2012-01-02 5
2012-01-03 9
2012-01-04 7

如果您想将动物园索引作为列包含在 data.frame 中,可以执行类似 write.zoo 的操作:

zoo.to.data.frame <- function(x, index.name="Date") {
stopifnot(is.zoo(x))
xn <- if(is.null(dim(x))) deparse(substitute(x)) else colnames(x)
setNames(data.frame(index(x), x, row.names=NULL), c(index.name,xn))
}
<小时/>

更新:

为了简洁起见,在尝试编辑您的问题后,我想到了一种根据您的规范创建 df2b 的简单方法(如果您不这样做,这也适用于 z1下降尺寸):

R> (df2b <- data.frame(Date=time(z2), z2, check.names=FALSE, row.names=NULL))
Date Lepisma saccharina Thermobia domestica
1 2012-01-01 4 2
2 2012-01-02 5 6
3 2012-01-03 9 0
4 2012-01-04 7 11

关于R 在动物园对象和数据框之间进行转换,不同列数的结果不一致?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/14064097/

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