linux - 如何更改多个文件的第一行(包括文件名)？

Question

我的文件夹中有许多文件，名为:

ctg_1.fasta
lcd2_13.fasta 
..
etc (all of them are .fasta)

我想更改每个的第一行以包含以下内容:>ctg_1、>lcd2_13。我的意思是，每个文件都有自己的名称作为第一行。

我认为命令 sed 会对我有所帮助。我尝试执行这个:

var=">ctg_1"
sed -i "1s/.*/$var/" ctg_1.fasta

它可以工作，但我想递归地执行它，并且每个文件都包含自己的名称。

您知道如何实现这一目标吗？

Answer 1

使用find递归地获取所有文件。从带有文件名的变量中提取不带 .fasta 后缀的文件名，并在 sed 命令中使用它。

find . -type f -name '*.fasta' | while read -r f; do
    base=$(basename "$f" .fasta)
    sed -i "1s/.*/>$base/" "$f"
done