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我正在使用 rpy2 API 在 python 中实现一个简单的函数。
在 VScode 中,我设法打印一个置信区间,计算 Z 统计量调用使用 robjects 创建的函数,如图所示。但在打印值之前,我收到消息“无法确定 R 主目录:[WinError 2] 系统找不到指定的文件”。同样的消息出现在 Jupyter 中,但不允许我打印任何东西,当调用 rpy2 函数时,它得到错误“Conversion 'rpy2py' not defined for objects of type '
另外,仅导入包本身“import rpy2.robjects”会检索相同的消息。单独导入 rpy2 不会显示任何内容。
我尝试将 Rscript.exe 和 R.exe 路径添加到系统变量,但没有成功,它们都没有(不确定我是否正确设置),尝试重新安装 R,但没有成功。
关于如何解决这个问题的任何线索?
Image of the function being used and it's output in VSCode The output for the same function as before but in jupyter
最佳答案
错误的原因是 Windows R 更改了它的注册表结构,这使得当前 rpy2
的 R 安装路径检测已过时。我推了一个 PR解决这个问题,但与此同时,您的解决方案是设置 R_HOME
环境变量。
这是你可以做的:
import os
os.environ["R_HOME"] = r"C:\Program Files\R\R-4.2.0" # change as needed
import rpy2
只要在导入任何 rpy2
模块之前运行 os.environ...
行,就可以开始了。
附带说明一下,您还可以设置 os.environ["R_LIBS_USER"]
以使用每个用户的库路径。
关于python - 使用 rpy.robjects 时出现一条消息 "Unable to determine R home: [WinError 2] The system could not find the specified file",我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/72356173/
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