r - 当 read.table 中的 5 行之后出现不同数量的列时，fill=TRUE 会失败吗？

Question

这个问题在这里已经有了答案:





How can you read a CSV file in R with different number of columns

(5 个回答)


6年前关闭。




假设我们有一个文件名 test.txt其中包含未知数量的列:

1   2   3   4   5
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5   6   7   8
1   2   3   4   5
1   2   3   4   5   6
1   2   3   4   5   6
1   2   3   4   5   6

fill=T当第 8 行超过 5 列时失败:

read.table('test.txt', header=F, sep='\t', fill=T)

结果:

   V1 V2 V3 V4 V5
1   1  2  3  4  5
2   1  2  3  4  5
3   1  2  3  4  5
4   1  2  3  4  5
5   1  2  3  4  5
6   1  2  3  4  5
7   1  2  3  4  5
8   1  2  3  4  5
9   6  7  8 NA NA
10  1  2  3  4  5
11  1  2  3  4  5
12  6 NA NA NA NA
13  1  2  3  4  5
14  6 NA NA NA NA
15  1  2  3  4  5
16  6 NA NA NA NA

但与 skip=3 ，一切正常

read.table('test.txt', header=F, sep='\t', fill=T, skip=3)

我们得到了我们所期望的:

  V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8
1  1  2  3  4  5 NA NA NA
2  1  2  3  4  5 NA NA NA
3  1  2  3  4  5 NA NA NA
4  1  2  3  4  5 NA NA NA
5  1  2  3  4  5  6  7  8
6  1  2  3  4  5 NA NA NA
7  1  2  3  4  5  6 NA NA
8  1  2  3  4  5  6 NA NA
9  1  2  3  4  5  6 NA NA

为什么会发生这种情况？是不是因为 fill=T只检查前 5 行？有没有办法解决这个问题？

Answer 1

我在 read.table 的示例中找到了正确的答案。

ncol <- max(count.fields('test.txt', sep = "\t"))
read.table('test.txt', header=F, sep='\t', fill=T, col.names=paste0('V', seq_len(ncol)))

这是因为 fill=T只检查前五行。解决方法是指定 col.names .