r - 连接抖动点的线 - 多组躲避

Question

我尝试在 x 轴上连接来自两种不同方法 (measure) 的测量值之间的抖动点。这些测量值通过先证者 (a) 相互关联，可以分为两个主要组，患者 (pat) 和对照 (ctr),我的 df 是这样的:

set.seed(1)
df <- data.frame(a = rep(paste0("id", "_", 1:20), each = 2),
                 value = sample(1:10, 40, rep = TRUE),
                 measure = rep(c("a", "b"), 20), group = rep(c("pat", "ctr"), each = 2,10))

我试过了

library(ggplot2)
ggplot(df,aes(measure, value, fill = group)) + 
  geom_point(position = position_jitterdodge(jitter.width = 0.1, jitter.height = 0.1,
                                             dodge.width = 0.75), shape = 1) +
  geom_line(aes(group = a), position = position_dodge(0.75))

^{由 reprex package 创建于 2020-01-13 (v0.3.0)}

我使用了 fill 美学来将抖动的点与两组(pat 和 ctr)分开。我意识到，当我将 group = a 美学放入 ggplot 主调用中时，它并没有很好地分离，但似乎更好地链接到要点。

我的问题:有没有办法更好地将线连接到(抖动的)点，但保持两个主要组 ctr 和 pat 的分离？

非常感谢。

Answer 1

你遇到的大问题是你只通过 group 来躲避点，但是 a 也躲过了线。

要使您的线与轴保持原样，一种选择是手动躲避您的数据。这利用了引擎盖下的整数因子，将 group 的一个级别向右移动，另一个向左移动。

df = transform(df, dmeasure = ifelse(group == "ctr", 
                                     as.numeric(measure) - .25,
                                     as.numeric(measure) + .25 ) )

然后您可以用 measure 作为 x 轴绘制一个图，然后在 geom_point 和 geom_line< 中使用“dodged”变量作为 x 轴变量.

ggplot(df, aes(x = measure, y = value) ) +
     geom_blank() +
     geom_point( aes(x = dmeasure), shape = 1 ) +
     geom_line( aes(group = a, x = dmeasure) )

如果您还想要抖动，也可以手动将其添加到您的 x 和 y 变量中。

df = transform(df, dmeasure = ifelse(group == "ctr", 
                                     jitter(as.numeric(measure) - .25, .1),
                                     jitter(as.numeric(measure) + .25, .1) ),
               jvalue = jitter(value, amount = .1) )

ggplot(df, aes(x = measure, y = jvalue) ) +
     geom_blank() +
     geom_point( aes(x = dmeasure), shape = 1 ) +
     geom_line( aes(group = a, x = dmeasure) )