numpy - 如何在 Ubuntu 上安装最新版本的 NumPy/Scipy/Matplotlib/IPython/Pandas

Question

用户sometimes need to know如何安装比操作系统包管理器提供的更新版本的 Pandas。 Pandas 需要 NumPy，并且与 SciPy、Matplotlib 和 IPython 配合使用效果最佳。

如何安装最新版本的 NumPy/Scipy/Matplotlib/IPython/Pandas？

Answer 1

使用Ubuntu，这里是如何安装整个NumPy/Scipy/Matplotlib/IPython/Pandas使用 Python2.7 在 vi​​rtualenv 中从 Github 进行堆栈:

注意:以下说明安装每个软件包的最新开发版本。如果您希望安装最新的标记版本，则在 git clone 之后，检查可用的标记

git tag

然后选择您要安装的版本

git checkout tag-name

安装virtualenv和 virtualenvwrapper :

sudo apt-get install python-virtualenv
sudo pip install virtualenvwrapper

# edit ~/.bashrc to include
source /usr/share/virtualenvwrapper/virtualenvwrapper.sh

# edit ~/.profile to include
export WORKON_HOME=$HOME/.virtualenvs

# You may have to log out then log back in to make the change effective

创建一个虚拟环境

mkvirtualenv --system-site-packages dev
workon dev

# If you want to make this virtual environment your default Python,
# edit ~/.bashrc to include
workon dev

将站点包添加到 sys.path:

add2virtualenv $USER/.virtualenvs/dev/lib/python2.7/site-packages

安装Cython

pip install -U Cython

安装git

sudo apt-get install git

安装NumPy

cd ~/src
git clone https://github.com/numpy/numpy.git

sudo apt-get install python-dev build-essential  
sudo apt-get install libatlas-base-dev libatlas3gf-base

# ensure clean build
# this is not necessary the first time, but useful when upgrading
cd ~/src/numpy
/bin/rm -rf ~/src/numpy/build
cdsitepackages && /bin/rm -rf numpy numpy-*-py2.7.egg-info

cd ~/src/numpy
python setup.py build --fcompiler=gnu95
python setup.py install

安装SciPy

cd ~/src
git clone https://github.com/scipy/scipy.git

# ensure clean build
cd ~/src/scipy
/bin/rm -rf ~/src/scipy/build
cdsitepackages && /bin/rm -rf scipy scipy-*-py2.7.egg-info

cd ~/src/scipy
git clean -xdf
python setup.py install

安装 Matplotlib 依赖项

pip install -U pyparsing
pip install -U six
pip install -U python-dateutil
pip install -U pytz
sudo apt-get install libzmq-dev
pip install -U tornado pygments pyzmq 
pip install -U nose
sudo apt-get install python-qt4 python-qt4-doc python-pyside python-cairo python-wxgtk2.8 python-gtk2 dvipng

apt-cache depends python-matplotlib | awk '/Depends:/{print $2}' | xargs dpkg --get-selections
sudo apt-get build-dep python-matplotlib

安装Matplotlib

cd ~/src/
git clone https://github.com/matplotlib/matplotlib

# ensure clean build
cd ~/src/matplotlib
/bin/rm -rf ~/src/matplotlib/build
cdsitepackages && /bin/rm -rf matplotlib* mpl_toolkits

# compile and install
cd ~/src/matplotlib
python setup.py build
python setup.py install

安装IPython

cd ~/src
git clone https://github.com/ipython/ipython.git

# ensure clean build
cd ~/src/ipython
/bin/rm -rf ~/src/ipython/build
cdsitepackages && /bin/rm -rf ipython-*-py2.7.egg

cd ~/src/ipython
python setupegg.py install

安装Pandas

cd ~/src
git clone https://github.com/pydata/pandas.git
cd ~/src/pandas

# update
git fetch origin
git rebase --interactive origin/master

# ensure clean build and install
/bin/rm -rf ~/src/pandas/{build,dist} && cdsitepackages && /bin/rm -rf pandas* && cd ~/src/pandas && python setup.py build_ext --inplace && python setup.py install 

<小时/>

更新:

优点git 的做法是它提供了一种始终保留这些包的方法最新:

cd ~/src/package-name
git fetch origin
git rebase --interactive origin/master

按照上面的说明进行操作，以确保干净的构建，然后重建并重新安装该软件包。

直接在 GitHub 上使用 pip 的简写

上述克隆和安装软件包的步骤可以使用 pip 在一定程度上自动化。例如，我们也可以像这样安装NumPy:

pip install git+git://github.com/numpy/numpy.git

更新就只是

pip install numpy --upgrade --force-reinstall

可能需要

--force-reinstall 标志，因为 pip 从 PyPI 检查版本，如果当前版本不较小，则不会更新。