r - R 中具有离散值的 Violinplot

Question

我正在尝试根据计数数据在 R 中创建 fiddle 图。我使用的数据是在每个来源的每个样本中发现的一些突变。

看起来像这样:

2 Source1
8 Source2
0 Source1
1 Source1
9 Source2
...

我已经使用下面的代码创建了多个绘图。

ggplot(df_combined, aes(factor(names), y=mutations)) + 
geom_violin() +
geom_boxplot(width=.1, outlier.size=0, fill="grey50") +
stat_summary(fun.y=median, geom="point", fill="white", shape=21, size=4) +
xlab("Source") +
ylab("Number of mutations") +
theme(axis.text = element_text(colour = "black"))`

虽然它们中的大多数表现得很好，但其中一些开始“摇摆不定”(我能解释的最好方式)这是一个不起作用的例子。

我想这是因为我的数据是离散的而不是连续的，但我找不到任何关于如何改变 fiddle 图的数据。有什么办法可以让它与 ggplot2 和 geom_violin 一起使用吗？

数据如下:

structure(list(mutations = c(6, 6, 6, 6, 6, 6), names = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L,   
1L), .Label = c("1kG", "CG"), class = "factor")), .Names = c("mutations", "names"), 
row.names = c(NA, 6L), class = "data.frame") 

Answer 1

我从Winston Chang那里得到了答案on the ggplot2 forum .诀窍是使用 geom_violin(adjust=2)，这将使图形平滑。