R-重复测量方差分析的部分 eta 平方(汽车包)

Question

我有一个 2 路重复测量设计 (3 x 2)，我想了解如何计算效应大小(部分 eta 平方)。

我有一个包含数据的矩阵(称为 a)，就像这样(重复测量)

         A.a          A.b           B.a        B.b          C.a           C.b
1        514.0479     483.4246      541.1342   516.4149     595.5404      588.8000
2        569.0741     550.0809      569.7574   599.1509     621.4725      656.8136
3        738.2037     660.3058      812.2970   735.8543     767.0683      738.7920
4        627.1101     638.1338      641.2478   682.7028     694.3569      761.6241
5        599.3417     637.2846      599.4951   632.5684     626.4102      677.2634
6        655.1394     600.9598      729.3096   669.4189     728.8995      716.4605

idata=

    Caps    Lower
       A       a
       A       b
       B       a
       B       b
       C       a
       C       b

我知道如何对汽车包进行重复测量方差分析(类型 3 SS 在我的领域是标准的，尽管我知道这会导致逻辑错误..如果有人想像我 5 一样向我解释这一点我很想理解它):

summary(Anova(lm(a ~ 1),
          idata=idata,type=3, 
          idesign=~Caps*Lower)),
    multivariate=FALSE)

我想我想做的是将这部分摘要打印出来:

假设球形的单变量 III 型重复测量方差分析

                     SS num Df Error SS den Df        F    Pr(>F)    
(Intercept)     14920141     1   153687      5 485.4072 3.577e-06 ***
Caps            33782        2     8770     10  19.2589  0.000372 ***
Lower           195          1    13887      5   0.0703  0.801451    
Caps:Lower      2481         2      907     10  13.6740  0.001376 ** 

并用它来计算部分预计到达时间的平方。因此，如果我没有记错的话，我需要从第一列中获取 SS，然后将其除以(本身 + 该行的 SS 错误)以获得每个效果。这是正确的做法吗？如果是这样，我该怎么做？我不知道如何从摘要打印输出中引用值。

Answer 1

可以使用heplots包中的etasq函数计算部分eta平方

library(car)
mod <- Anova(lm(a ~ 1),
idata = idata,
type = 3,
idesign = ~Caps*Lower)

mod

library(heplots)
etasq(mod, anova = TRUE)

既然你问的是计算:
来自?etasq:'对于单变量线性模型，经典 η^2 = SSH/SST 和部分 η^2 = SSH/(SSH + SSE)。这些在单向设计中是相同的。”。

如果您希望检查具有 class 的模型的 η^2 计算代码(如示例所示)，您可以使用 getS3method(f = "etasq", class =“Anova.mlm”)。