r - 子架构 'R' 未安装(在 RStudio 中安装某些 CRAN 软件包)

Question

我在 Mac OSX(版本 10.9.5)上使用 RStudio(版本 0.99.484)和 R(版本 3.2.3)。

不幸的是，我不记得我是否做了任何事情导致了这些更改，但从大约两周前开始，每当我尝试使用通常的语法从 CRAN 安装某些软件包时:

install.packages("packageName")

我在 RStudio 中收到错误消息。以下是我看到此问题的新软件包的示例:

install.packages("plotly")

给我错误消息:

  There is a binary version available but the source version is later:
       binary source needs_compilation
plotly 2.0.16  3.4.1             FALSE

installing the source package ‘plotly’

  % Total    % Received % Xferd  Average Speed   Time    Time     Time  Current
                                 Dload  Upload   Total   Spent    Left  Speed
  0     0    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0  0   343    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0
 38 1039k   38  399k    0     0  1724k      0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 1724k100 1039k  100 1039k    0     0  3376k      0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 8521k
* installing *source* package ‘plotly’ ...
** package ‘plotly’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** preparing package for lazy loading
Warning: package ‘ggplot2’ was built under R version 3.2.4
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
*** arch - R
ERROR: sub-architecture 'R' is not installed
*** arch - x86_64
Warning: package ‘ggplot2’ was built under R version 3.2.4
ERROR: loading failed for ‘R’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/plotly’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘plotly’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/private/var/folders/vn/lhzbs8ds6xbg965nnfcj6ftm0000gn/T/RtmpmyVFR4/downloaded_packages’

不止一个包裹发生了这种情况(在过去的两周里似乎很突然)。但是，并非所有软件包都会发生这种情况。我想知道如何解决这个问题，因为我使用 RStudio、Mac OSX、R 等。当我在 Google 上搜索错误消息“子架构‘R’未安装”时，我看到的资源很少。

运行 R.Version() 时:

$platform
[1] "x86_64-apple-darwin13.4.0"

$arch
[1] "x86_64"

$os
[1] "darwin13.4.0"

$system
[1] "x86_64, darwin13.4.0"

$status
[1] ""

$major
[1] "3"

$minor
[1] "2.3"

$year
[1] "2015"

$month
[1] "12"

$day
[1] "10"

$`svn rev`
[1] "69752"

$language
[1] "R"

$version.string
[1] "R version 3.2.3 (2015-12-10)"

$nickname
[1] "Wooden Christmas-Tree"

Answer 1

在查看 Plotly 的依赖性时，它似乎需要 R ≥ 3.1 的 ggplot2 版本。因此，只需将您的基础 R 更新到版本 3.1 或更高版本即可。重要的是，它不是您的 Rstudio，而是您的基础 R。

如果所有其他方法都失败，请尝试安装到 Windows 10、Rstudio 版本 0.99.892 和 R 3.2.4，因为我无法使用这些恰好是最新的版本来复制此问题。