r - 在没有当前行的情况下使用 rollaply

Question

我有一个简单的 data.frame，我想在其中滚动计算一些汇总统计数据。例如，五个观测值(2 个滞后、当前 1 个和 2 个超前)的窗口上的滚动中位数是通过以下方式实现的:

library(dplyr)
x <- data.frame("vals" = rnorm(3e04))
y <- x %>%
         mutate(med5 = rollapply(data = vals, 
                width = 5, 
                FUN = median, 
                align = "center", 
                fill = NA, 
                na.rm = TRUE))

但是，我想从该计算中排除当前行。我发现了以下方法:

z <- x %>% 
      mutate(N=1:n()) %>% 
      do(data.frame(., prmed = sapply(.$N, function(i) median(.$vals[.$N %in% c((i - 2):(i - 1), (i + 1):(i + 2))]))))

如果我随后将前两个值设置为 NA，这将实现我想要的效果。

到目前为止一切顺利，唯一的问题是后一种方法与 rollapply 相比非常慢。

有没有办法以前者的速度达到后者的结果？

Answer 1

基于排除五个数字中的第三个数字(即计算的当前行)的解决方案。

library(dplyr)
library(zoo)

set.seed(124)

x <- data.frame("vals" = rnorm(3e04))
y <- x %>%
  mutate(med5 = rollapply(data = vals, 
                          width = 5, 
                          FUN = function(x) median(x[-3], na.rm = TRUE), 
                          align = "center", 
                          fill = NA))

head(y)
#          vals      med5
# 1 -1.38507062        NA
# 2  0.03832318        NA
# 3 -0.76303016 0.1253147
# 4  0.21230614 0.3914015
# 5  1.42553797 0.4562678
# 6  0.74447982 0.4562678