r - 在 Mac OSX 中从源安装 R 包时出错-找不到 "make"命令

Question

我遇到了 R 的问题，我似乎无法弄清楚如何解决。

尝试从源代码安装 R 包时，我遇到了以下错误:

* installing *source* package ‘cthresh’ ...
** libs
*** arch - i386
sh: make: command not found
ERROR: compilation failed for package ‘cthresh’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/cthresh’

这会让您认为我没有安装编译器或未设置 $PATH。两者都不是真的。我已经安装了 XCode 并且 echo $PATH 给我:

echo $PATH
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/bin:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/Current/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/bin:/usr/X11/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Developer-3.2.5/usr/bin:/Users/admn/bin:/usr/local/bin:/Developer-3.2.5/usr/bin

所以你可以看到 Developer 出现在/usr/bin 中

我什至通过以下方式确认:

export PATH=${PATH}:/Developer-3.2.5/usr/bin

如果我在 bash 或 sh 中调用“make”:

sh-3.2$ make make: * No targets specified and no makefile found. Stop.

bash-3.2$ make make: * No targets specified and no makefile found. Stop.

编译器在那里:

bash-3.2$ gcc i686-apple-darwin10-gcc-4.2.1: no input files

bash-3.2$ g++ i686-apple-darwin10-g++-4.2.1: no input files

那么是什么给了？为什么 R 不能“制造”？我真的对此不知所措，似乎无法在任何地方找到答案!我的猜测是 R 没有在寻找合适的编译器之类的东西，但我无法弄清楚如何检查它在寻找什么以及为什么它在“make”时失败

我在 MacBook Pro 上使用 OSX Lion。请帮忙!

---编辑----

好的，我在这个问题上取得了一些进展。尽管我添加了

PATH=${PATH}:/Developer-3.2.5/usr/bin

对于我的 bash/sh .profile，我还需要将它添加到 .Renviron 文件中。我在以下位置找到该文件:/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/etc/

但现在我收到了这个错误:

• installing source package ‘cthresh’ ... ** libs * arch - i386 make: * No rule to make target ._cthreb.o', needed bycthresh.so'. Stop. ERROR: compilation failed for package ‘cthresh’

这让我觉得可能有额外的东西要添加到这个 .Renviron 文件中？关于什么的任何想法？

Answer 1

您需要从 Xcode 4 for Lion 的首选项中安装“命令行工具”。否则，仅在 Lion 中安装 Xcode 无法使用 gcc。