r - 使用共享列和不同行合并 R 中的数据帧

Question

我在这里尝试使用合并功能，但我很困惑。我很抱歉，因为这看起来很基本，但是 by.x 和 by.y 函数让我很困惑。我想提取数据框 A 和数据框 B 之间的共享列，然后将两个数据框合并在一起。数据框不共享任何分类单元(第一列)，但它们将共享 X1 - X10000 等列的一部分。这些数据框中的每一个都有约 8,000 列和几百行。在此示例中，变量 X2 和 X5 是共享的，但其他变量 X1 和 X3 未共享。基于相交的列名称向量，我知道数据帧共享约 3000 列。

数据框 A:

 Taxa   X1      X2      X5
 118    T       N       A
 113    N       N       A
 60     C       Y       G
 121    N       N       N

数据框 B:

 Taxa  X2      X3      X5
 200   C       G       N
 119   T       N       G
 30    C       G       G
 21    C       N       N

所需的合并数据框:

 Taxa    X2      X5
 118     N       A
 113     N       A
 60      Y       G
 121     N       N
 200     C       N
 119     T       G
 30      C       G
 21      C       N

当我尝试以各种方式使用合并功能时，我得到了这个(这里有我的实​​际列号):

      Taxa      X408050  X995019   
NA    <NA>     <NA>     <NA>       
NA.1  <NA>     <NA>     <NA>     
NA.2  <NA>     <NA>     <NA>       
NA.3  <NA>     <NA>     <NA>      
NA.4  <NA>     <NA>     <NA>     
NA.5  <NA>     <NA>     <NA>      
NA.6  <NA>     <NA>     <NA>      

Answer 1

采纳 PierreLafortune 的建议，我将留下我的建议作为答案。既然你说你在两个数据框中都有 8000 列，你想找出两者之间哪些列名是共同的。为了找到共同的列，您可以使用intersect()。一旦有了必要的列名，就可以对数据框进行子集化。然后，您可以合并这两个数据框。

ind <- intersect(names(mydf), names(mydf2))

rbind(mydf[, ind], mydf2[, ind])

#  Taxa X2 X5
#1  118  N  A
#2  113  N  A
#3   60  Y  G
#4  121  N  N
#5  200  C  N
#6  119  T  G
#7   30  C  G
#8   21  C  N

数据

mydf <- structure(list(Taxa = c(118L, 113L, 60L, 121L), X1 = c("T", "N", 
"C", "N"), X2 = c("N", "N", "Y", "N"), X5 = c("A", "A", "G", 
"N")), .Names = c("Taxa", "X1", "X2", "X5"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-4L))

mydf2 <- structure(list(Taxa = c(200L, 119L, 30L, 21L), X2 = c("C", "T", 
"C", "C"), X3 = c("G", "N", "G", "N"), X5 = c("N", "G", "G", 
"N")), .Names = c("Taxa", "X2", "X3", "X5"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-4L))