bash - 检查特定列中的单词，检查该行其他列中的值，将该行剪切并粘贴到新的文本文件

Question

我的文本文件包含约 20k 行，如下所示:

文件_A:

ATOM    624  SC1 SER   288      54.730  23.870  56.950  1.00  0.00
ATOM   3199  NC3 POP   487      50.780  27.750  27.500  1.00  3.18        
ATOM   3910  C2B POP   541      96.340  99.070  39.500  1.00  7.00         
ATOM   4125  W    PW   559      55.550  64.300  16.880  1.00  0.00            

现在我需要检查第 4 列(第 2 行和第 3 行)中的 POP，并检查最后一列 (10) 中的值是否超过特定阈值(例如 5.00)。这些行——在本例中只是第 3 行——需要从 file_A 中删除并复制到新的 file_B。含义:

文件_A:

ATOM    624  SC1 SER   288      54.730  23.870  56.950  1.00  0.00
ATOM   3199  NC3 POP   487      50.780  27.750  27.500  1.00  3.18    
ATOM   4125  W    PW   559      55.550  64.300  16.880  1.00  0.00

文件_B:

ATOM   3910  C2B POP   541      96.340  99.070  39.500  1.00  7.00

我不确定是否要使用 sed、grep 或 awk 或任何结合它们的方法:/到目前为止，我可以只删除这些行并创建一个没有这些行的新文件...

awk '!/POP/' file_A > file_B

---

编辑:

以下是否适用于删除多个不同的词？

for (( i= ; i<$numberoflipids ; i++ ))
do
        awk '$4~/"${nol[$i]}"/&&$NF>"$pr"{print >"patch_rmlipids.pdb";next}{print > "tmp"}' bilayer_CG_ordered.pdb && mv tmp patch.pdb
done

而 $nol 是一个包含要删除的单词的数组，$pr 是给定的阈值，而 .pdb 是使用的文件

Answer 1

哇

awk '$4~/POP/&&$NF>5{print >"fileb";next}{print > "tmp"}' filea && mv tmp filea

.

$4~/POP/&&$NF>5  -Checks if fourth field contains POP and last field is more than five

{print >"fileb";next} -If they are writes the line to fileb and 
                        skips further statements

{print > "tmp"} -Only executed if first part fails, write to tmp file 

filea && mv tmp filea -The file used, if awk command succeeds then overwrite
                        it with tmp