r - 无法在 Jupyter 笔记本中加载 IRKernel

Question

我是论坛的新手，所以如果这个问题已经得到解答，我很抱歉。我环顾四周，虽然我发现有些人有类似的问题，但我在以前的帖子中找不到解决我的问题的方法。所以 - 这里是...

我运行的是 Mac OS X 10.11.5、Jupyter 笔记本版本 4.2.1、R 版本 3.2.2

我使用以下命令安装了 Jupyter 笔记本的 R 内核 -

conda install -c r r-irkernel

现在，当我启动 Jupyter 笔记本时，我看到“R”作为选项之一出现在右侧“笔记本”下的下拉菜单中。但是，当我尝试创建 R 笔记本时，内核崩溃，并且我在终端中收到以下错误:

WARNING:root:kernel b42781ab-ebb1-45eb-8a54-d3801106fb94 restarted
Error: .onLoad failed in loadNamespace() for 'pbdZMQ', details:  
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Users/avislova/anaconda/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so':
  dlopen(/Users/avislova/anaconda/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so,     6): Library not loaded: @rpath/libzmq.5.dylib
  Referenced from: /Users/avislova/anaconda/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so
  Reason: image not found
Execution halted
 [W 16:19:12.382 NotebookApp] KernelRestarter: restart failed
 [W 16:19:12.382 NotebookApp] Kernel b42781ab-ebb1-45eb-8a54-d3801106fb94 died, removing from map.
ERROR:root:kernel b42781ab-ebb1-45eb-8a54-d3801106fb94 restarted failed!
 [W 16:19:12.390 NotebookApp] Kernel deleted before session
 [W 16:19:12.390 NotebookApp] 410 DELETE /api/sessions/2236e334-e33a-483b-87f3-31c461d4903b (::1) 1.32ms referer=http://localhost:8888/notebooks/Untitled5.ipynb?kernel_name=ir

知道我可以从这里去哪里吗？

谢谢!

Answer 1

在我的 Mac 上更新“R”后，我遇到了类似的问题。

以下步骤解决了我的问题

install.packages(c('pbdZMQ', 'repr', 'devtools'))  
devtools::install_github('IRkernel/IRdisplay')
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()  

详情请参阅http://johnlaudun.org/20160521-irkernel-difficulties/