r - as.dendrogram 错误

Question

我正在尝试使用大数据制作树状图

我正在使用stats、phyclust 库，

distances <- phyclust.edist(Data[,],edist.model = .edist.model[3]) 
dataHClust <- hclust(distances, "ave")
dhc <- as.dendrogram(dataHClust)

hclust 工作正常，我可以绘制它并且它正确地绘制了它。在我使用 as.dendrogram 函数后，它没有给我一个错误。但是当我:

• 尝试绘制它
• 使用 dendrapply 应用函数。

它说:

Error in lapply(args, is.character) : node stack overflow 
Error in dev.flush() : node stack overflow

问题是 as.dendrogram 无法处理大型数据集(~30000)吗？如果是这样，是否有替代方案？

Answer 1

我认为绘制大型数据集存在问题，因为我能够让您的代码在小型数据集上运行。

您可以尝试使用 as.dendrogram 中的 h 或 height 参数切割树状图，使其适合绘图。