r - 与( Shiny 的)服务器断开连接 : cause of large Plotly R heatmaps

Question

我正在开发一个相当复杂的 Shiny 应用程序，它在私有(private) Shiny 服务器上运行。只有包含大型绘图热图 (50-70Mb) 的页面无法在线运行(但这些页面在我的本地计算机上运行良好)。我收到的是通常的消息“与服务器重新加载断开连接”。显示此错误消息时，/var/log 中不会生成日志文件。

我尝试做的是:

• 检查是否是缺少包的问题，​​不是；

• 检查是否是路径错误的问题，不是；

• 修改/etc/shiny-server/中包含的shiny-server.conf文件，添加顶行:http_keepalive_timeout 300; sockjs_heartbeat_delay 300;

所以我相信问题与地 block 的大小有关。该如何面对这个问题呢？不幸的是，由于 Shiny 的应用程序的大小，在这里展示我的案例的可重复示例并不容易。

Answer 1

我在使用 heatmaply 包时遇到了同样的问题，该包依赖于 dendextend 包。 dendextend 包依赖于递归表达式，该表达式很容易超出服务器上运行的 R 版本允许的嵌套表达式数量。请参阅此问题:https://github.com/talgalili/dendextend/issues/53 。

您可以尝试将表达式限制设置为远高于默认值 5000，看看这是否有帮助(允许的最大值为 500,000)。

options(expressions = 500000)