r - 使用 data.table 中的 fread() 会导致 R session 中止

Question

我正在开发一个 MOOC 项目，并正在修改 RStudio 中的 data.table 包。使用 fread() 函数导入数据文件最初工作正常:

fread("UCI HAR Dataset/features.txt")->features
fread("UCI HAR Dataset/test/y_test.txt")->ytest

但是，当我尝试运行以下代码行时，我收到一个弹出窗口，显示“R session 中止:R 遇到 fatal error 。 session 已终止。”

fread("UCI HAR Dataset/test/X_test.txt")->xtest

我不明白问题出在哪里。我检查了文件名和路径，以确保我的拼写和大小写都正确，并且全部检查完毕。使用 read.table() 的等效代码工作正常并且不会导致 R 中止。我也尝试将文件重命名为“x_test.txt”，但出现了同样的问题。

根据?fread，只有该函数仅适用于“常规分隔文件”。据我所知，该文件是一个“常规分隔文件”，因为所有行都具有相同的列数。当我使用 read.table 时，没有包含“NA”的单元格；我使用 anyNA() 进行了检查。有没有一种快速方法可以确定文件是否是“定期”分隔的文件？原始文件是否还有其他内容可能导致问题？

<小时/>

更新

经过进一步研究和搜索开发者github上列出的报告问题，我认为我的问题在于每行开头有两个空格，对此进行了讨论 here 。我不确定为什么 R 中止而不是给我警告。不过，最新开发版本的 data.table (1.9.5) 不会导致 session 在相同条件下中止。

Answer 1

虽然我确实相信您应该在 R session 中止的任何情况下首先联系软件包维护者(并且这不是由于您对 C 代码进行了修改)，但我可以为您的最后一个请求提供一个策略，即并不是专门针对 fread 但我发现常规读取()很有用。我假设这是一个逗号分隔的文件，但如果它是空格分隔的，您可以将 sep="," 更改为 sep=""。

filcnts <- count.fields("UCI HAR Dataset/test/X_test.txt", sep=",")
table(filcnts)

那应该是一个单项表。如果没有，请尝试切换参数，例如 quote、sep、blank.lines.skip 或 comment.char