r - Shiny 应用程序中的 "read_excel"

Question

我有一个 Shiny 的应用程序，它使用 xlsx 包中的 read.xlsx 函数。一切正常，但我想从 readxl 更改为 read_excel，希望它会更快并且能够处理大文件。

用户界面部分:

fileInput("inputFile","Upload file...")

服务器部分:

  data <- reactive({
    inFile <- input$inputFile
    if (is.null(inFile)) { return(NULL) }    
    dataFile <- read_excel(inFile$datapath,sheet=1)
    return(dataFile)
  })

我收到“未知格式”错误。

inFile$datapath is "/tmp/.../60974676c7287e913d1c0dc5/0"
inFile$type is "application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet"

问题1:有没有办法告诉read_excel这是一个xlsx类型文件？
问题2:是否可以控制上传文件的存储位置？

Answer 1

这是一个open issue与 readxl 包。当前提供的解决方法是复制文件数据路径并附加 .xlsx。这是我的机器上的一个工作示例，仅限于编辑为使用 file.rename 而不是 file.copy 的 .xlsx 文件。

library(shiny)
library(readxl)

runApp(
    list(
        ui = fluidPage(
            titlePanel("Use readxl"),
            sidebarLayout(
                sidebarPanel(
                    fileInput('file1', 'Choose xlsx file',
                              accept = c(".xlsx")
                              )
                    ),
                mainPanel(
                    tableOutput('contents'))
                )
            ),
        server = function(input, output){
            output$contents <- renderTable({
                inFile <- input$file1

                if(is.null(inFile))
                    return(NULL)
                file.rename(inFile$datapath,
                          paste(inFile$datapath, ".xlsx", sep=""))
                read_excel(paste(inFile$datapath, ".xlsx", sep=""), 1)
            })
        }
        )
    )

编辑请注意，使用 1.1.0 版本的 readxl 不再需要重命名文件。现在，以下内容对我来说没有问题。

library(shiny)
library(readxl)

runApp(
  list(
    ui = fluidPage(
      titlePanel("Use readxl"),
      sidebarLayout(
        sidebarPanel(
          fileInput('file1', 'Choose xlsx file',
                    accept = c(".xlsx")
          )
        ),
        mainPanel(
          tableOutput('contents'))
      )
    ),
    server = function(input, output){
      output$contents <- renderTable({

        req(input$file1)

        inFile <- input$file1

        read_excel(inFile$datapath, 1)
      })
    }
  )
)