java - 创建一个方法来返回 DNA 链的 WC 补体

Question

好的，所以我被要求创建一个方法pplementWC()，其工作原理如下:

public String complementWC()

返回 Watson Crick 补集，它是表示互补 DNA 链(即双螺旋中的另一条链)的字符串。因此，将所有 T 替换为 A，所有 A 替换为 T，所有 C 替换为 G，所有 G 替换为 C。

这就是我设法做到的:

private String dna;

    public String complementWC(){
        String dnaWC = "";
        for(int i=0;i<dna.length();i++){
            if(dna.charAt(i) == 'T'){
                dna.replace(dna.charAt(i), 'A');
            }
            if(dna.charAt(i) == 'A'){
                dna.replace(dna.charAt(i), 'T');
            }
            if(dna.charAt(i) == 'C'){
                dna.replace(dna.charAt(i), 'G');
            }
            if(dna.charAt(i) == 'G'){
                dna.replace(dna.charAt(i), 'C');
            }   
            dnaWC = dna;
        }
        return dnaWC;
    }

现在的问题是这个方法只返回原始 DNA 而不是 WCcomplement。因此，我不确定如何将 for 循环内的字符串存储到名为“dnaWC”的新字符串中。

Answer 1

字符串是不可变的。当您调用 replace 时，它会返回一个新字符串，而不是更改原始字符串，并且您会立即忽略返回的字符串。这就是为什么你的原始字符串从未改变。

您可以使用StringBuilder构建一个新字符串，这将节省每次替换字符时创建新字符串的开销，因为只会创建一个新字符串。

public String complementWC(){
    StringBuilder builder = new StringBuilder();
    for(int i=0;i<dna.length();i++){
        char c = dna.charAt(i);
        if(dna.charAt(i) == 'T'){
            builder.append('A');
        }
        if(dna.charAt(i) == 'A'){
            builder.append('T');
        }
        if(dna.charAt(i) == 'C'){
            builder.append('G');
        }
        if(dna.charAt(i) == 'G'){
            builder.append('T');
        }   
    }
    return builder.toString();
}