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R运行相关性,忽略非数字数据

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-01 18:28:00 24 4
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我尝试使用以下代码在所有数字值之间运行关联(数据集包含数字和非数字值的列):

mydata= read.csv("C:\\full_path\\playerData.csv", header = TRUE)
mydata=data.frame(mydata)
vals=cor(mydata, use="complete.obs", method="pearson")
write.csv(vals,"C:\\Users\\weiler\\Desktop\\RStudioOutput.csv")

基于此网站:http://www.statmethods.net/stats/correlations.html我收到错误:

Error in cor(mydata, use = "complete.obs", method = "pearson") : 'x' must be numeric

我的错误似乎是因为某些数据是非数字的。有没有一种简单的方法来忽略非数字数据?

最佳答案

正如 David Arenburg 所说,您可以使用 is.numeric 然后使用子集。这是一个解释。

mydata <-
data.frame(alpha1=letters[1:10], alpha2=letters[11:20],
num1=runif(10), num2=runif(10))

# alpha1 alpha2 num1 num2
# 1 a k 0.02123999 0.50840184
# 2 b l 0.23963061 0.27622386
# 3 c m 0.32220265 0.69144157
# 4 d n 0.08147787 0.59194675
# 5 e o 0.15875212 0.61067014
# 6 f p 0.87679916 0.65882239
# 7 g q 0.94408782 0.07846614
# 8 h r 0.41669714 0.18997531
# 9 i s 0.35965571 0.90215068
# 10 j t 0.64287793 0.84273345

哪些列是数字?

sapply(mydata, is.numeric)

# alpha1 alpha2 num1 num2
# FALSE FALSE TRUE TRUE

因此,使用这个 bool 向量进行子集化,您将得到数字列

my_num_data <- mydata[, sapply(mydata, is.numeric)]

# num1 num2
# 1 0.5118055 0.82442771
# 2 0.3512970 0.12066818
# 3 0.4344065 0.94698653
# 4 0.1222383 0.72324135
# 5 0.1974004 0.51563337
# 6 0.2794483 0.06022451
# 7 0.1519816 0.32559160
# 8 0.5129894 0.76990432
# 9 0.2433832 0.08038982
# 10 0.7893464 0.45767856

现在你可以运行 cor()

cor(my_num_data, use = "complete.obs", method = "pearson")

# num1 num2
# num1 1.0000000 0.2852567
# num2 0.2852567 1.0000000

并将其显示为一行:

cor(mydata[, sapply(mydata, is.numeric)],
use = "complete.obs", method = "pearson")

关于R运行相关性,忽略非数字数据,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/27850592/

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