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我有一个相当密集的散点图,我正在使用 R 'ggplot2' 构建它,并且我想使用 'ggrepel' 来标记点的子集。我的问题是,我想绘制散点图中的所有点,但只用 ggrepel 标记一个子集,当我这样做时,ggrepel 在计算放置标签的位置时不会考虑图上的其他点,这导致到与绘图上其他点重叠的标签(我不想标记)。
这是说明该问题的示例图。
# generate data:
library(data.table)
library(stringi)
set.seed(20180918)
dt = data.table(
name = stri_rand_strings(3000,length=6),
one = rnorm(n = 3000,mean = 0,sd = 1),
two = rnorm(n = 3000,mean = 0,sd = 1))
dt[, diff := one -two]
dt[, diff_cat := ifelse(one > 0 & two>0 & abs(diff)>1, "type_1",
ifelse(one<0 & two < 0 & abs(diff)>1, "type_2",
ifelse(two>0 & one<0 & abs(diff)>1, "type_3",
ifelse(two<0 & one>0 & abs(diff)>1, "type_4", "other"))))]
# make plot
ggplot(dt, aes(x=one,y=two,color=diff_cat))+
geom_point()
如果我只绘制想要标记的点的子集,则 ggrepel 能够以相对于其他点和标签不重叠的方式放置所有标签。
ggplot(dt[abs(diff)>2 & (!diff_cat %in% c("type_3","type_4","other"))],
aes(x=one,y=two,color=diff_cat))+
geom_point()+
geom_text_repel(data = dt[abs(diff)>2 & (!diff_cat %in% c("type_3","type_4","other"))],
aes(x=one,y=two,label=name))
但是,当我想同时绘制该数据子集和原始数据时,我得到带有标签的重叠点:
# now add labels to a subset of points on the plot
ggplot(dt, aes(x=one,y=two,color=diff_cat))+
geom_point()+
geom_text_repel(data = dt[abs(diff)>2 & (!diff_cat %in% c("type_3","type_4","other"))],
aes(x=one,y=two,label=name))
如何获取点子集的标签,使其不与原始数据中的点重叠?
最佳答案
您可以尝试以下操作:
""
),以便 geom_text_repel
在相互排斥标签时将它们考虑在内;box.padding
默认参数 0.25
更大的值,标签之间的距离更大;示例代码(带有 box.padding = 1
):
ggplot(dt,
aes(x = one, y = two, color = diff_cat)) +
geom_point() +
geom_text_repel(data = . %>%
mutate(label = ifelse(diff_cat %in% c("type_1", "type_2") & abs(diff) > 2,
name, "")),
aes(label = label),
box.padding = 1,
show.legend = FALSE) + #this removes the 'a' from the legend
coord_cartesian(xlim = c(-5, 5), ylim = c(-5, 5)) +
theme_bw()
这是另一次尝试,box.padding = 2
:
(注意:我使用的是 ggrepel 0.8.0。我不确定早期软件包版本是否提供所有功能。)
关于R ggplot2 ggrepel - 在了解所有点的同时标记点的子集,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/52397363/
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