- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我想计算图的平均聚类系数(来自igraph
包)。但是,我不确定应该遵循哪种方法。
library(igraph)
graph <- erdos.renyi.game(10000, 10000, type = "gnm")
# Global clustering coefficient
transitivity(graph)
# Average clustering coefficient
transitivity(graph, type = "average")
# The same as above
mean(transitivity(graph, type = "local"), na.rm = TRUE)
如果您能提供一些指导,我将不胜感激。
最佳答案
使用transitivity(graph)
计算全局聚类系数(transitivity):
This is simply the ratio of the triangles and the connected triples in the graph. For directed graph the direction of the edges is ignored.
同时,transitivity(graph, type = "average")
是 transitivity(graph, type = "local")
的平均值,首先计算局部聚类系数并然后对它们进行平均:
The local transitivity of an undirected graph, this is calculated for each vertex given in the vids argument. The local transitivity of a vertex is the ratio of the triangles connected to the vertex and the triples centered on the vertex. For directed graph the direction of the edges is ignored.
参见,例如,?传递性
和Clustering coefficient .
因此,首先这两种措施都是有效的,选择应该取决于您的目的。它们之间的区别非常明显(请参阅维基百科页面):
It is worth noting that this metric places more weight on the low degree nodes, while the transitivity ratio places more weight on the high degree nodes. In fact, a weighted average where each local clustering score is weighted by k_i(k_i-1) is identical to the global clustering coefficient
其中 k_i 是顶点 i 邻居的数量。因此,也许同时使用它们也是相当公平的。
关于r - 网络的平均聚类系数(igraph),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/48853610/
我有一个 N x 2 的整数表,称为 games[ , ]。节点/边表转换为图形: net edges g ecount(g) 7 > degree(g, 103, mode="out") 4
我开始评估 igraph 库及其功能。 我需要计算 igraph_de_bruijn() 函数生成的图的哈密顿路径。 igraph 库中是否有任何现成的功能?我不想从头开始实现它。 C中的一个例子将是
我正在尝试像这样深度复制我的 igraph 对象: copy.deepcopy(graph) 其中 graph 是 igraph 对象,一个只有几个顶点的完整图。但是我得到这个错误: Fi
我有一个需要过滤的大图。过滤(子图)后,我最终得到一个子图列表。我需要再次将所有这些子图组合成一个图。我不知道如何组合大列表(近百万个子图) > require(igraph) > graph V(
我有一个简单的问题,函数 community.to.membership 在 igraph 1.0 中是否被弃用了?我可以找到 membership 函数,但它不包括选项 merges、steps 等
我正在使用 R 中的 igraph。我知道我们可以用选定的顶点创建一个子图,但如果这些节点没有直接连接,那么新子图中将不会有边。如果有其他节点(不是顶点列表的一部分)间接连接这两个节点,有没有办法制作
我正在使用 R 中的 igraph。我知道我们可以用选定的顶点创建一个子图,但如果这些节点没有直接连接,那么新子图中将不会有边。如果有其他节点(不是顶点列表的一部分)间接连接这两个节点,有没有办法制作
是否有与此 igraph 等效的 R function在 Python igraph 中? graph_from_data_frame(d, directed = TRUE, vertices = N
a=g.vs(Name_eq="A") b=g.vs(Name_eq="B") 我想在 a 和 b 之间添加一条边,我该怎么做? 最佳答案 好的,我们这里好像有两个问题。一个在问题标题中:“如果我们有
我有一个大型无向加权图,其中包含约 375,000 个节点和约 3,400,000 个边,表示为邻接表(字典的字典)。 例如 A --> (B,2), (C,4) B --> (A,2) C -->
igraph here 中对可用的社区检测算法进行了很好的比较。 .但是,在可以应用于加权边的算法中使用权重存在一些歧义。 通常,边缘权重将被定向,以便更高的权重表明将节点保持在一起(例如友谊的强度)
我在 igraph 中使用了 fastgreedy 算法在加权无向图中进行社区检测。后来我想看看模块化性,不同的方法我得到了不同的值,我想知道为什么。我提供了一个简短的示例,它演示了我的问题: lib
我正在使用 igraph g <- graph_from_adjacency_matrix(adj2, mode = "directed") plot.igraph(g, vertex.size =
我想知道如果 igraph-R 包中没有实现基于模块化聚类的算法,由 Newman 于 2004 年发布:“Fast algorithm for detection community structu
我有一个类似的问题:Reading adjacency lists with isolated nodes using igraph 我想绘制一些没有关系的节点。但是由于某种原因,上面线程中提到的解决
我有一个交互网络,我使用以下代码制作邻接矩阵,随后计算网络节点之间的相异性,然后将它们聚类以形成模块: ADJ1=abs(adjacent-mat)^6 dissADJ1% as.dist %
我想使用 igraph 来探索一些网络数据。我的数据具有以下结构: a <- c(13, 32, NA, NA) b <- c(32, NA, NA, NA) c <- c(34, 13, 32, N
我使用 igraph graph_from_data_frame 函数从数据框构建了一个图。我的前两列代表边缘列表,我还有另一列名为“权重”。还有其他几个属性列。 然后我尝试使用 cluster_fa
我的问题如下: 考虑一个具有 10000 个节点和 4800 条边的无向图。 给定这个图和这个图的一个节点(例如,节点 1),我需要 igraph (R) 中的一个命令来获取这个节点 1 和图中最远节
我已指导 igraph 并想获取所有周期。 girth 函数有效,但只返回最小的周期。 R 中有没有办法在长度大于 3 的图中获取所有循环(没有顶点指向自身和循环) 最佳答案 它不是 igraph 中
我是一名优秀的程序员,十分优秀!