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r - org-mode remote R 不适用于 org 8.0.7

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-01 14:51:12 25 4
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我有一个包含 R 源代码块的 org 文件。现在我想在我的服务器上远程执行其中的一些或实际上全部。我按照组织手册中的设置进行操作,并像下面的示例一样使用 =dir:= (出于明显的原因,我没有显示我的用户名或服务器名称;但是我可以不用密码连接,所以 ssh 设置是可以的) :

#+BEGIN_SRC R :dir /xxx@xxx: :exports both
system("hostname")
#+END_SRC

当我用 C-c C-c 评估它时,我得到以下结果:

executing R code block...
Tramp: Encoding region using function `base64-encode-region'...done
Tramp: Decoding region into remote file /ssh:xxx@xxx:/var/folders/2m/4d7t6kwx0tn2p6blmf3l7_kh0000gn/T/R-30000dMv...done
byte-code: Couldn't write region to `/ssh:xxx@xxx:/var/folders/2m/4d7t6kwx0tn2p6blmf3l7_kh0000gn/T/R-30000dMv', decode using `base64 -d -i >%s' failed

显然远程文件夹存在一些问题,因为在我的服务器上我没有写入/var 的权限,或者实际上/var/folders 不存在,它只存在于我的 Mac 本地。

当我尝试使用 sh 时收到类似的错误消息:

#+BEGIN_SRC sh :dir /xxx@xxx: :export both
hostname
#+END_SRC

有人对此有解决方案吗?或者在远程机器上执行 R 代码的替代方法?

我的Emacs版本是24.3,org 8.0.7

提前感谢您的任何回复!

更新:

我找到了以下帖子 emacs org-mode mailing list这似乎与我的问题有关。如果代码是远程执行的,确实 org 似乎使用了错误的文件名。我不知道如何解决这个问题,或者我是否可以自己找到解决方案...

更新:

另一种远程执行 R 代码的方法如下:

使用“M-x ssh”启动远程 ssh 连接,连接到您的服务器,在那里启动 R 并在远程缓冲区中调用“M-x ess-remote”。现在,当将远程 R 缓冲区的名称指定为“session”时,它将远程执行代码:

#+BEGIN_SRC R :exports both :results output :session *ssh xxx*
system( "hostname" )
#+END_SRC

这将返回服务器的主机名(注意,上面的“xxx”将是您的服务器名)。重要 ":results value"将导致与临时文件相同的问题,目前只有 ":results output"似乎有效。

更新及解决方案:

所以 :results output 是要走的路。这也适用于 :dir 远程代码执行。

最佳答案

我会先测试 Tramp 是否可以在您的 Emacs 上运行。

关于r - org-mode remote R 不适用于 org 8.0.7,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/18470240/

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