- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我有多个这样的文件:
文件1:
rsRNA-2312-n 2
rsRNA-6508-n 2
rsRNA-6382-n 10
rsRNA-951-n 0
rsRNA-6330-n 4
rsRNA-6330-n 11
rsRNA-1385-n 3
rsRNA-4945-n 0
rsRNA-946-n 9
文件2:
rsRNA-552-n 2
rsRNA-5301-n 7
rsRNA-6487-n 0
rsRNA-4945-n 7
rsRNA-2445-n 9
rsRNA-6490-n 2
文件3:
rsRNA-4946-n 1
rsRNA-5058-n 0
rsRNA-552-n 0
rsRNA-849-n 2
rsRNA-3302-n 2
rsRNA-4099-n 0
rsRNA-552-n 1
我想合并创建一个输出的文件,该输出在单独的列中具有每个输入文件的值,在第 1 列中具有唯一标识符(输入文件中的第 1 列)。如果在特定输入文件中未找到标识符,则对于此特定输入,此标识符的计数应为 0。
输出类似(非真实数据):
identifier file1 file2 file3
rsRNA-552-n 2 4 5
rsRNA-5301-n 7 12 2
rsRNA-6487-n 0 1 5
rsRNA-4945-n 7 12 1
rsRNA-2445-n 9 4 55
rsRNA-6490-n 2 1 0
正在尝试:
paste <(awk '{print $2}' file1 ) <(awk '{print $2}' file2 ) <(awk '{print $2}' file3) <(awk '{print $2}' file4)
并使用 for 循环:
for f in file*; do
base_name=${f%.txt}
id=${base_name#*_}
awk > "output${id}"
done
最佳答案
使用 shell 循环来操作文本始终是错误的方法。只需使用 awk,这就是它的设计目的。将 GNU awk 4.* 用于真正的多维数组和 ARGIND 并在 in
中排序:
$ cat tst.awk
{
split($1,a,/-/)
key = a[2]
key2name[key] = $1
key2val[key][ARGIND] = $2
}
END {
printf "identifier"
for (fileNr=1;fileNr<=ARGIND;fileNr++) {
printf "%s%s", OFS, ARGV[fileNr]
}
print ""
PROCINFO["sorted_in"] = "@ind_num_asc"
for (key in key2name) {
printf "%s", key2name[key]
for (fileNr=1;fileNr<=ARGIND;fileNr++) {
printf "%s%s", OFS, (fileNr in key2val[key] ? key2val[key][fileNr] : 0)
}
print ""
}
}
.
$ awk -f tst.awk file1 file2 file3
identifier file1 file2 file3
rsRNA-552-n 0 2 1
rsRNA-849-n 0 0 2
rsRNA-946-n 9 0 0
rsRNA-951-n 0 0 0
rsRNA-1385-n 3 0 0
rsRNA-2312-n 2 0 0
rsRNA-2445-n 0 9 0
rsRNA-3302-n 0 0 2
rsRNA-4099-n 0 0 0
rsRNA-4945-n 0 7 0
rsRNA-4946-n 0 0 1
rsRNA-5058-n 0 0 0
rsRNA-5301-n 0 7 0
rsRNA-6330-n 11 0 0
rsRNA-6382-n 10 0 0
rsRNA-6487-n 0 0 0
rsRNA-6490-n 0 2 0
rsRNA-6508-n 2 0 0
我添加了 key
的轻微额外复杂性作为第一个字段的数字部分,因此在输出结果时,它们可以在该子字段上按数字排序。
关于perl - 合并由两列组成的文件,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/32770802/
编辑:我将问题重新表述为更简单且不那么特定领域的问题: 在下面的代码中,我想实现 mplus 函数,该函数结合了受特定字段存在约束的两个函数。结果函数应受两个字段的存在的约束。 谢谢 ! import
我的代码有什么问题?提前致谢! 我正在尝试为我的 docker 容器设置一个虚拟主机。在本地主机上:8000 完美运行,但是当我尝试通过 http://borgesmelo.local/访问时,出现错
这个问题在这里已经有了答案: CSS technique for a horizontal line with words in the middle (34 个答案) 关闭 2 年前。 首先,这是
我是 React Js 的新手,并尝试了解如何通过 ajax 对从不同来源获得的数据进行组合(如下所述: Reactjs - loadResourcesFromServer - combine two
我一直在关注 this tutorial在 docker 服务和 swarms 上。但是我在不同 docker 容器之间的网络连接上遇到了一些问题。 以下是我的 docker-compose.yml
我正在尝试创建一个相对简单的设置来开发和测试 npm 包。事实上,一个问题是,在将代码卷安装到容器后,它会替换 node_modules。 我尝试了很多通常合乎逻辑的东西,主要是为了将 node_mo
我有四种类型A、B、C和D,初始值x Future[Option[A]] 和三个函数:f1: A => Option[B] , f2: B => Future[Option[C]] 和 f3: C =
我有一个包含单词的语料库。我想对他们做一个分析。我接受它们是土耳其字符,但其中一些不是。所以我想检查一个词是否不包含土耳其字符或数字。我的意思是: hey4 valid 33 vali
这是我正在为 Java 入门课解决的学校问题。作业是编写一个程序,生成一个由随机生成的二进制数组成的 8 x 8 矩阵,并让程序检查哪些列(如果有)全为 0,以及主对角线和次对角线是否也由零组成。主对
我正在尝试编写一个由任意数量的 lambda 函数组成的函数。 我有两个简单的 lambda 函数。 f = lambda x: x + 1 g = lambda x: x**2 我对组合函数的尝试是
我在这里学习 Docker Compose 教程 https://docs.docker.com/get-started/part5/#recap-optional version: "3" serv
我正处于要为应用程序编写 androidTests 的状态。 阅读 Testing Compose 的文档,我创建了一个文件并编写了一个简单的测试来检查进度: ExamineTest.kt: clas
我最近刚跨过木偶继承。围绕它的几个问题: 使用p继承是一种好习惯吗?一些经验丰富的木偶同事告诉我,木偶的继承不是很好,我不太相信。 来自OO世界,我真的很想了解木偶继承的原理,以及覆盖的原理。 最佳答
我正在尝试使用 docker-compose 创建一个基本网页 这是我的 yml 文件 identidock: build: . ports: - "5000:5000" envir
我们有docker-compose.yml,其中包含Kafka,zookeeper和schema registry的配置 当我们启动docker compose时,出现以下错误 docker-comp
我在玩 Haskell 的类型时无意中发现了 length 。总和 有效。是否有一些语义应该允许它工作,或者这仅仅是类型定义的一个缺点?我在下面编写了每个类型定义。 length :: Foldabl
如何防止缩小仅包含 JFormattedTextFields 的 JPanel。 JFormattedTextField textF1; JFormattedTextField textF2;
我尝试更 retrofit 载我的 Docker 卷的用户,但执行此操作的是“root”用户,而不是“安全用户”。知道如果我在 Dockerfile 中执行“chown -R/var/www”,这将不
我正在尝试将 scalaz 的 ioeffect IO[E,A] monad 用于一段非常有效的代码。 我试图用 IO[E,A] 在高层次上重写的代码需要一些关于存储在云中的文件的元数据。代码试图:
这个问题已经有答案了: What special characters must be escaped in regular expressions? (13 个回答) 已关闭 5 年前。 java中
我是一名优秀的程序员,十分优秀!