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将 colnames 替换为 colname 的子字符串

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-01 13:45:54 24 4
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我想知道如何将数据框的列名替换为原始列名中的唯一字符串?

> colnames(df.iso)
[1] "../trimmed/100G.tally.fasta" "../trimmed/100R.tally.fasta" "../trimmed/106G.tally.fasta"
[4] "../trimmed/106R.tally.fasta" "../trimmed/122G.tally.fasta" "../trimmed/122R.tally.fasta"
[7] "../trimmed/124G.tally.fasta" "../trimmed/124R.tally.fasta" "../trimmed/126G.tally.fasta"
[10] "../trimmed/126R.tally.fasta" "../trimmed/134G.tally.fasta" "../trimmed/134R.tally.fasta"

最佳答案

我们可以使用 sub?basename 从列名中提取子字符串。将输出分配回列名称以反射(reflect)更改。

colnames(df.iso) <- sub("\\..*", '', basename(colnames(df.iso)))

如果我们不想使用basename,也可以单独使用sub

colnames(df.iso) <- sub("([^/]+/){2}([^.]+).*",
"\\2", colnames(df.iso))

关于将 colnames 替换为 colname 的子字符串,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/36251386/

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