r - 在没有重叠点的情况下绘制 spatstat 中的残差

Question

这可能非常简单，但我花了很多时间试图弄清楚但没有任何运气，也许任何人都可以帮助我。

我通过 spatstat 中的 ppm() 函数拟合了点模式模型(下面的可重现代码)，当我绘制残差时，它会自动在残差图像上绘制点，这使得很难看到任何东西。有谁知道如何避免它？

代码:

library(spatstat)
pattern <- rpoispp(300)
cov <- rnoise(rgen = rnorm, dimyx=32, mean=2, sd=1, w = pattern$window)
fit <- ppm(pattern ~ cov)
res <- residuals.ppm(fit, type = "raw")
plot(res, how = "imagecontour")

Answer 1

数据点没有被“过度绘制”在残差之上:残差测量包括每个数据点的质量“原子”，以及平滑的密度，因此情节是正确的。

如果问题是因为代表原子的符号太大而看不到细节，那么您可以使用参数之一markscale 或maxsize 将传递给 plot.ppp。

话又说回来，如果有很多数据点，最好只平滑残差度量。如果 res 是您计算的残差度量，则尝试 plot(Smooth(res))。有关详细信息，请参阅 Smooth.msr 的帮助。

如果您确实需要提取残差度量的平滑密度分量，您可以遵循 Ege 的建议，或者使用 with.msr。例如

with(res, Smooth(qlocations %mark% density)) 

给出表示残差测量的连续分量的图像。

这些注释仅适用于原始残差，其中所有原子的质量都为 1。对于其他类型的残差，原子的质量不相等，显示它们变得更加重要。