r - 如何禁用 knitr 图中的透明度？

Question

我有一个 LaTeX/knitr 文档，我需要将其转换为 PDF/A，但我收到有关使用透明度的错误(这在 PDF/A 中是不允许的)。我将其追溯到我通过 knitr 在 R 中生成的箱线图的背景填充。无论我使用“pdf”、“cairo_pdf”还是“tikzDevice”作为输出设备，都会产生相同的错误。

Tikz 输出包括以下内容:

\definecolor{fillColor}{RGB}{255,255,255}
\path[use as bounding box,fill=fillColor,fill opacity=0.00] (0,0) rectangle (505.89,325.21);

手动删除 fill opacity=0.00 部分并仅重新运行 pdflatex 会删除特定图形的消息，所以我很确定这就是原因。但是，我更愿意在源文件(R 代码)中进行更改，这样我就不必在每次源更改和重新生成中间文件时都手动进行此修复。

有谁知道在 R 中输入 bxp 或 par 的神奇选项，这会转化为 1.0 的不透明度，或者更好的是，根本不指定填充？ (填充是完全没有必要的，因为它是放置在页面空白部分的白色背景。)

(顺便说一句，我在 bxp 调用中尝试了 bg=NA，之前也尝试过 par(bg=NA)，但都没有效果。就此而言，使用 "red" 也没有效果，因此这似乎不是正确的选择。)

Answer 1

显然，图形参数 (par=) 中的 bg 仅适用于图中的对象(如箱线图中的框)。整个情节的背景在 knitr 的 dev.args block 选项中设置，例如，全局:

opts_chunk$set(dev='tikz', dev.args=list(bg="white"))

或在特定 block 的开头。似乎没有办法完全删除填充选项(tikzDevice source code 中有一个“TODO”项)，但将其更改为 “white” 已经消除了 PDF/A 验证错误，没有对文档的可见效果。一旦我的论文发表，也许我可以为此提交一个补丁。 :-)