r - 循环遍历数据框的列以使用 ggplot2 创建图

Question

我正在努力克服这个问题。不能再进一步了。

我有一个包含因子和数字变量的数据框。此处显示的是前几行和几列。

# A tibble: 6 x 5
  cluster SEV_D SEV_M   OBS   PAN  
    <int> <dbl> <dbl> <fct> <fct>  
1       1     5     1    0     1    
2       2     6     1    0     0    
3       1     5     1    0     1    
4       2     4     2    0     0    
5       1     4     1    1     1    
6       1     4     2    1     0   

cluster=as.factor(c(1,2,1,2,1,1))  
SEV_D=as.numeric(c(5,6,5,4,4,4))
SEV_M=as.numeric(c(1,1,1,2,1,2))
OBS=as.factor(c(0,0,0,0,1,1))
PAN=as.factor(c(1,0,1,0,1,0))
data<-data.frame(cluster,SEV_D,SEV_M,OBS,PAN) 

我像这样拆分数据框，在数字和因子变量中，在两个子集中保留“集群”，因为我需要它进行分组。

data_fact <- data[, sapply(data, class) == 'factor']

data_cont <- data[, sapply(data, class) == 'numeric' | names(data) 
== "cluster"]

以下两段代码将生成我想要的图。

data_fact %>% group_by(cluster,OBS)%>%summarise(total.count=n()) %>% 
ggplot(., aes(x=cluster, y=total.count, fill=OBS)) + 
geom_bar(position = 'dodge', stat='identity') + 
geom_text(aes(label=total.count),  
position=position_dodge(width=0.9), vjust=-0.2)

data_cont %>% group_by(cluster) %>% dplyr::summarise(mean = 
mean(SEV_D), sd = sd(SEV_D)) %>% 
ggplot(.,aes(x=cluster,y=mean))+geom_bar(position=position_dodge(), 
stat="identity",colour="black",size=.3)+geom_errorbar(aes(ymin=mean- 
sd, ymax=mean+sd),size=.3,width=.4,position=position_dodge(.4)) + 
ggtitle("SEV_D")

我的目标是创建与数据框中的变量一样多的图表，遍历列并将此类图表存储在一张表中。

我的尝试是

col<-names(data_fact)[!names(data_fact)%in%"cluster"]

for(i in col) {
data_fact %>% group_by(cluster,i)%>%summarise(total.count=n()) %>% 
ggplot(., aes(x=cluster, y=total.count, fill=i)) + geom_bar(position 
= 'dodge', stat='identity') + geom_text(aes(label=total.count), 
position=position_dodge(width=0.9), vjust=-0.2)
}

但是它抛出这个错误:

grouped_df_impl(data, unname(vars), drop) 错误: i 列未知

最重要的是，恐怕该代码不会在一张纸上显示所有图表。任何帮助将不胜感激!!!

Answer 1

上面的链接是一个很好的引用。或者查看 Rstudio 的 tidyeval 备忘单:https://github.com/rstudio/cheatsheets/raw/master/tidyeval.pdf

要计算 ggplot 语句中的 i，您需要使用 !!ensym( ) 函数构造取消引用字符串。此外，您还需要使用 print 语句来打印循环内的图。

library(ggplot2)

col<-names(data_fact)[!names(data_fact)%in%"cluster"]

for(i in col) {
   print(i)

   g<-data_fact %>% group_by(cluster, !!ensym(i)) %>% summarise(total.count=n()) %>% 
     ggplot(., aes(x=cluster, y=total.count, fill=!!ensym(i))) + 
     geom_bar(position  = 'dodge', stat='identity') + 
     geom_text(aes(label=total.count), position = position_dodge(width=0.9), vjust=-0.2) +
     labs(title=i)
  print(g)
}