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r - igraph包中的ncol格式数据

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-01 11:44:17 34 4
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在文档中,http://igraph.sourceforge.net/doc/R/read.graph.html

NCOL 格式

Large Graph Layout 程序 (http://bioinformatics.icmb.utexas.edu/lgl) 使用此格式,它只是一个符号加权边列表。它是一个简单的文本文件,每行一条边。一条边由两个由空格分隔的符号顶点名称定义。 (符号顶点名称本身不能包含空格。)它们可能后跟一个可选数字,这将是边的权重;数字可以是负数,可以是科学计数法。如果没有为边指定权重,则假定为零。

生成的图始终是无向的。LGL 无法处理包含多个边或循环边的文件,但是这里没有检查,因为 igraph 对这些很满意。

句子 (The resulting graph is always undirected.) 是什么意思?

我使用 ncol 格式读取数据。

g<-read.graph("file.ncol",format="ncol",directed=TRUE)
is.directed(g)
TRUE

结果为真。所以我认为该图是有向的。但为什么文档说生成的图总是无向的?

最佳答案

这可能是文档中的错误(或者是 directed 参数尚不存在的早期 igraph 版本的遗留问题)。我建议你file a bug report .

关于r - igraph包中的ncol格式数据,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/16853049/

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