r - 在汇总的 tibble 中保留 chisq.test 的多个值

Question

我对正在执行卡方检验的数据进行了分组，并希望返回一个汇总表，其中包含来自 htest 对象的多个值。例如 ( from a previous question ),

library(dplyr)

set.seed(1)
foo <- data.frame(
  partido=sample(c("PRI", "PAN"), 100, 0.6),
  genero=sample(c("H", "M"), 100, 0.7), 
  GM=sample(c("Bajo", "Muy bajo"), 100, 0.8)
)

foo %>% 
  group_by(GM) %>% 
  summarise(p.value=chisq.test(partido, genero)$p.value))

返回 p 值，但我想从 htest 对象中获取多个值(比如 p.value 和 statistic)作为汇总表中的不同列返回。

我试过了

foo %>%
  group_by(GM) %>%
  summarise(htest=chisq.test(partido, genero)) %>%
  mutate(p.value=htest$p.value, statistic=htest$statistic)

但这会引发错误

Error in summarise_impl(.data, dots) :
Column htest must be length 1 (a summary value), not 9

您如何使用 tidyverse 工具完成此任务？

Answer 1

另一种选择是利用 broom::tidy

library(broom)
library(tidyverse)
foo %>%
    group_by(GM) %>%
    nest() %>%
    transmute(
        GM,
        res = map(data, ~tidy(chisq.test(.x$partido, .x$genero)))) %>%
    unnest()
## A tibble: 2 x 5
#  GM      statistic p.value parameter method
#  <fct>       <dbl>   <dbl>     <int> <chr>
#1 Bajo       0.0157   0.900         1 Pearson's Chi-squared test with Yates' c…
#2 Muy ba…    0.504    0.478         1 Pearson's Chi-squared test with Yates' c…