string - R:如何根据规范更改数据框中的列名

Question

我有一个数据框，它的开头如下:

                                SM_H1455          SM_V1456          SM_K1457      SM_X1461          SM_K1462
ENSG00000000419.8                290               270               314               364               240
ENSG00000000457.8                252               230               242               220               106
ENSG00000000460.11               154               158               162               136                64
ENSG00000000938.7              20106             18664             19764             15640             19024
ENSG00000000971.11                30                10                 4                 2                10

请注意，还有更多的列和行。

这是我想要做的:我想更改列的名称。列名称中最重要的信息，例如SM_H1455，是字符串的第4个字符。在这种情况下，它是一个 H。如果第 4 个字符是“H”或“K”，我想要做的是将“SM”部分更改为“Control”，如果第 4 列是“X”或“Case” “V”。我想保留名称中的所有其他内容。所以最后，我想要一张这样的 table :

                        Control_H1455          Case_V1456        Control_K1457      Case_X1461        Control_K1462
ENSG00000000419.8                290               270               314               364               240
ENSG00000000457.8                252               230               242               220               106
ENSG00000000460.11               154               158               162               136                64
ENSG00000000938.7              20106             18664             19764             15640             19024
ENSG00000000971.11                30                10                 4                 2                10

请记住，第 4 个字符是“V”、“X”、“K”还是“H”是完全随机的。

我很感激任何帮助!谢谢。

Answer 1

一种方式，在哪里x是你的df:

controls <- which(substring(names(x),4,4) %in% c("H","K"))
cases <- which(substring(names(x),4,4) %in% c("X","V"))
names(x)[controls] <- gsub("SM","Control",names(x)[controls])
names(x)[cases] <- gsub("SM","Case",names(x)[cases])

或者:

names(x) <- sapply(names(x),function(z) {
    if(substring(z,4,4) %in% c("H","K"))
        sub("SM","Control",z)
    else if(substring(z,4,4) %in% c("X","V"))
        sub("SM","Case",z)
})