r - R中的简单密码子到氨基酸哈希

Question

我想创建一个 R 脚本，其中我有一个哈希表，我可以在其中查找密码子并获取其相关氨基酸。例如，

library(hash)

hashTable <- hash(...) #insert all codon-to-amino acid pairs
hashTable['TTT']

会回来

[1] Phe

有人知道我该怎么做吗？或者也许是一个包(Bioconductor？)我可以安装它会让这更容易吗？

Answer 1

这个问题几乎肯定有一个预先存在的解决方案。一种可能性是 Bioconductor 的 Biostrings ，例如:

library(Biostrings)
GENETIC_CODE[["ATG"]]
[1] "M"