r - 将 CSV 数据转换为矩阵到 R 中的热图

Question

为我正在撰写的一篇论文做一些可视化，但一直在将数据从 CSV 加载表传输到矩阵(以便之后能够从中绘制热图)。

我这样做:

dta.tesiscsv<- read.csv("dtatesis.csv", header=TRUE)

加载如下所示的数据样本:

Col,Row,Kf
1,1,100
1,2,97.14285714
2,1,100 
...,...,...

但我有点迷失在下一步(创建一个空矩阵并根据公式将数据从表传输到它):

X<- matrix(nrow= 48, ncol=12)
X[dta.test[,c(1:2)]] <- dta.test$Kf

Answer 1

您可以使用 reshape2 包中的 acast 来获取您想要的矩阵形式的数据。

require(reshape2)
acast(dta.test, Row ~ Col, value.var = "Kf")

这将用 NA 填充缺失值。如果你想填充它们，例如，用 0 代替，那么，

acast(dta.test, Row ~ Col, value.var = "Kf", fill = 0)

会做到这一点。您可以使用 heatmap(.) 将其包裹起来以获取热图。