- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我正在尝试计算红外光谱中峰值坐标的一系列高斯曲线。用于计算 0 至 4000 1/cm 频率范围 (X) 内的单峰的脚本正常运行。然而,当我尝试迭代 75 个频率和强度坐标的范围时,我得到 4001 个“x”值和 75 个峰值坐标对之间的广播形状冲突。有没有办法隔离计算,使其表现得像一系列独立的计算,从而避免冲突?
这是我的代码和错误回溯:
import numpy as np
def gaussian(intens, mu):
x = np.arange(4001)
sig = 50
return intens*np.exp(-np.power(x-mu, 2.)/(2*np.power(sig, 2.)))
results = np.empty((4001, 1), float)
for i in range(75):
mu = np.array([106.2516, 169.2317, 179.4433, 210.1843, 225.1875, 237.6963, 261.1454,
290.3952, 298.8429, 383.1141, 394.5482, 415.7989, 474.0785, 522.2687,
555.9868, 571.7233, 617.1713, 646.9524, 712.1052, 757.1555, 839.7896,
862.2479, 874.9923, 927.4888, 948.9697, 951.0036, 964.3596, 969.371,
1008.6015, 1039.7932, 1044.8249, 1063.0541, 1107.298, 1127.9082, 1155.2848,
1180.83, 1196.411, 1225.1961, 1234.4729, 1256.5558, 1278.3917, 1284.0116,
1311.6421, 1338.709, 1346.252, 1360.011, 1434.1602, 1439.0059, 1455.3892,
1490.6434, 1512.7327, 1517.3906, 1521.4376, 1525.9011, 1531.1185, 1540.3454,
1546.1395, 1554.7932, 1841.6486, 3045.7824, 3050.0779, 3053.1525, 3064.5046,
3070.2651, 3073.4956, 3094.2865, 3097.3753, 3101.0081, 3107.7236, 3108.5122,
3115.0888, 3117.7676, 3123.2296, 3127.9553, 3141.7127])
intens = np.array([3.609400e+00, 6.870000e-02, 1.425000e-01, 1.908000e-01, 2.848000e-01,
9.040000e-01, 7.114000e-01, 3.850000e-01, 1.899100e+00, 7.697000e-01,
1.484000e-01, 1.223400e+00, 5.366000e-01, 4.554700e+00, 2.007100e+00,
8.798000e-01, 9.361000e-01, 1.767700e+00, 4.380000e-01, 6.543100e+00,
4.705000e-01, 1.423900e+00, 5.475000e-01, 1.230200e+00, 3.059800e+00,
4.872000e-01, 1.293400e+00, 2.782900e+00, 5.430000e-02, 1.592800e+00,
2.582030e+01, 2.047560e+01, 1.544500e+00, 4.941600e+00, 1.135200e+00,
6.229000e-01, 3.967100e+00, 1.082100e+00, 5.126800e+00, 3.136400e+00,
3.190000e-02, 3.438700e+00, 6.669500e+00, 2.266600e+00, 1.033200e+00,
4.739000e+00, 4.292300e+00, 4.469500e+00, 6.858500e+00, 8.952200e+00,
2.593600e+00, 6.386200e+00, 4.342300e+00, 2.799900e+00, 1.920900e+00,
3.788000e-01, 4.900100e+00, 4.086800e+00, 2.093403e+02, 1.231370e+01,
1.935290e+01, 3.692450e+01, 2.791320e+01, 1.315910e+01, 2.868290e+01,
2.371370e+01, 1.425640e+01, 4.406400e+00, 7.293400e+00, 5.097790e+01,
4.594300e+01, 3.229710e+01, 1.685690e+01, 2.933100e+01, 2.938250e+01])
g_calc = map(gaussian(intens, mu), zip(intens, mu))
results = vstack(results, g_calc)
results
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-29-c890381ce491> in <module>()
35 2.371370e+01, 1.425640e+01, 4.406400e+00, 7.293400e+00, 5.097790e+01,
36 4.594300e+01, 3.229710e+01, 1.685690e+01, 2.933100e+01, 2.938250e+01])
---> 37 g_calc = map(gaussian(intens, mu), zip(intens, mu))
38 results = vstack(results, g_calc)
39 results
<ipython-input-29-c890381ce491> in gaussian(intens, mu)
4 x = np.arange(4001)
5 sig = 50
----> 6 return intens*np.exp(-np.power(x-mu, 2.)/(2*np.power(sig, 2.)))
7
8 results = np.empty((4001, 1), float)
ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (4001,) (75,)
最佳答案
如果我正确理解你的问题,你想要计算的是:
(如果这是正确的,我建议重新表述标题,因为这实际上并不是高斯所特有的。)
对于此类操作,我广泛使用numpy.meshgrid
。在这里,它基本上创建了二维数组,其中一个维度是频率网格(j
索引),另一个维度对应于不同的峰值(i
索引)。然后,您可以有效地调用这些数组上的所有 numpy 机制。看看下面的代码是否产生您期望的输出:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
intens = np.array([0.1, 0.22, 0.13, 0.51, 0.4])
freq_0 = np.array([500.3, 123.4, 1023.6, 2562.45, 3126.2])
sigmaf = np.array([10.3, 20.4, 5.6, 40.5, 26.2])
freq_mesh = np.linspace(0.0,4000.0, num=4001, endpoint=True)
[I, FM] = np.meshgrid(intens, freq_mesh)
[F0,FM] = np.meshgrid(freq_0, freq_mesh)
[SF,FM] = np.meshgrid(sigmaf, freq_mesh)
signal_2d_arr = I*np.exp(-(FM-F0)**2/(2*SF**2))
spectrum = np.sum(signal_2d_arr, axis = 1)
plt.figure()
plt.plot(freq_mesh, spectrum)
plt.show()
关于python - 如何隔离 python 'for loop' 中函数的计算以避免广播形状冲突?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/50533239/
我正在处理一组标记为 160 个组的 173k 点。我想通过合并最接近的(到 9 或 10 个组)来减少组/集群的数量。我搜索过 sklearn 或类似的库,但没有成功。 我猜它只是通过 knn 聚类
我有一个扁平数字列表,这些数字逻辑上以 3 为一组,其中每个三元组是 (number, __ignored, flag[0 or 1]),例如: [7,56,1, 8,0,0, 2,0,0, 6,1,
我正在使用 pipenv 来管理我的包。我想编写一个 python 脚本来调用另一个使用不同虚拟环境(VE)的 python 脚本。 如何运行使用 VE1 的 python 脚本 1 并调用另一个 p
假设我有一个文件 script.py 位于 path = "foo/bar/script.py"。我正在寻找一种在 Python 中通过函数 execute_script() 从我的主要 Python
这听起来像是谜语或笑话,但实际上我还没有找到这个问题的答案。 问题到底是什么? 我想运行 2 个脚本。在第一个脚本中,我调用另一个脚本,但我希望它们继续并行,而不是在两个单独的线程中。主要是我不希望第
我有一个带有 python 2.5.5 的软件。我想发送一个命令,该命令将在 python 2.7.5 中启动一个脚本,然后继续执行该脚本。 我试过用 #!python2.7.5 和http://re
我在 python 命令行(使用 python 2.7)中,并尝试运行 Python 脚本。我的操作系统是 Windows 7。我已将我的目录设置为包含我所有脚本的文件夹,使用: os.chdir("
剧透:部分解决(见最后)。 以下是使用 Python 嵌入的代码示例: #include int main(int argc, char** argv) { Py_SetPythonHome
假设我有以下列表,对应于及时的股票价格: prices = [1, 3, 7, 10, 9, 8, 5, 3, 6, 8, 12, 9, 6, 10, 13, 8, 4, 11] 我想确定以下总体上最
所以我试图在选择某个单选按钮时更改此框架的背景。 我的框架位于一个类中,并且单选按钮的功能位于该类之外。 (这样我就可以在所有其他框架上调用它们。) 问题是每当我选择单选按钮时都会出现以下错误: co
我正在尝试将字符串与 python 中的正则表达式进行比较,如下所示, #!/usr/bin/env python3 import re str1 = "Expecting property name
考虑以下原型(prototype) Boost.Python 模块,该模块从单独的 C++ 头文件中引入类“D”。 /* file: a/b.cpp */ BOOST_PYTHON_MODULE(c)
如何编写一个程序来“识别函数调用的行号?” python 检查模块提供了定位行号的选项,但是, def di(): return inspect.currentframe().f_back.f_l
我已经使用 macports 安装了 Python 2.7,并且由于我的 $PATH 变量,这就是我输入 $ python 时得到的变量。然而,virtualenv 默认使用 Python 2.6,除
我只想问如何加快 python 上的 re.search 速度。 我有一个很长的字符串行,长度为 176861(即带有一些符号的字母数字字符),我使用此函数测试了该行以进行研究: def getExe
list1= [u'%app%%General%%Council%', u'%people%', u'%people%%Regional%%Council%%Mandate%', u'%ppp%%Ge
这个问题在这里已经有了答案: Is it Pythonic to use list comprehensions for just side effects? (7 个答案) 关闭 4 个月前。 告
我想用 Python 将两个列表组合成一个列表,方法如下: a = [1,1,1,2,2,2,3,3,3,3] b= ["Sun", "is", "bright", "June","and" ,"Ju
我正在运行带有最新 Boost 发行版 (1.55.0) 的 Mac OS X 10.8.4 (Darwin 12.4.0)。我正在按照说明 here构建包含在我的发行版中的教程 Boost-Pyth
学习 Python,我正在尝试制作一个没有任何第 3 方库的网络抓取工具,这样过程对我来说并没有简化,而且我知道我在做什么。我浏览了一些在线资源,但所有这些都让我对某些事情感到困惑。 html 看起来
我是一名优秀的程序员,十分优秀!