awk - 在 awk 中使用 gsub 替换基于另一个字段的整个字段

Question

我有一个名为 data.txt 的制表符分隔文件，如下所示:

A       A/A     ATTAA/A      
GT      G/G     GT/GT   
T       T/TATATA   T/T

如果整个字段与 column1field/column1field 的形式匹配，我想用 REP 替换第 2-3 列中的字段。像这样:

A       REP     ATTAA/A      
GT      G/G     REP   
T       T/TATATA   REP

到目前为止，我有:

awk '{ gsub($1"/"$1,"REP",$0); print $0 }' data.txt

这很接近，但会在部分字段匹配时进行替换。像这样:

A       REP     ATTAREP      
GT      G/G     REP   
T       REPATATA   REP

我想合并 ^ 和 $ 但是这个:

awk '{ gsub(/^/$1"/"$1/$/,"REP",$0); print $0 }' data.txt

不起作用。

如有任何帮助，我们将不胜感激!

Answer 1

我会像这样使用 for 循环:

awk '{for(i=2;i<=NF;i++){if($i==$1"/"$1){$i="REP"}}}1' file

解释:

{
    # NF holds the number of fields in the record
    for(i=2;i<=NF;i++){
        if($i==$1"/"$1){
            $i="REP"
        }
    }
}

1 # Evaluates to true. awk will print the line