在ubuntu中安装R包

Question

这里有点菜鸟。我一直在 R 为 windows 工作，最近搬到了 ubuntu，(我认为是“Hardy Heron”)。我也不是一个 linux 人。反正。我正在尝试安装“diptest”包。我运行了命令

install.packages("diptest") 

输出是:

Installing package(s) into ‘/home/smart/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.6’ (as ‘lib’ is unspecified) which is a little strange since I'm running R 2.12.1. And then it hangs.

另外，如果我调用 library("diptest")它说我需要重新安装该软件包，因为它是为 R 2.6 构建的。重装过程与 install.packages不同吗？ ?谢谢。不好意思问这么简单的问题。

Answer 1

重新安装与安装完全相同，即 install.packages("diptest")。您可能想要使用选项 repos指向正确的存储库。好像出事了。 AFAIK R 使用该版本的正确存储库，但您的安装可能会发生一些奇怪的事情。确保您按照在 debian here 上安装 R 的说明进行操作.

所以对于我的 repo ，这将使:

install.packages("diptest",
   repos="http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12")

您可以使用命令 packageStatus() 获取一些信息。 .这也应该为您提供存储库，例如:

> update(packageStatus())
Number of installed packages:

                         ok upgrade unavailable
  E:/R/Library          111       1           2
  C:/R/R-2.12.2/library  26       2           0

Number of available packages (each package counted only once):

                                                              installed not installed
  http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12        99          2791
  http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/2.12         3            12

如果没问题，您可以检查该软件包是否已实际安装:

"diptest" %in% installed.packages()

如果是，您可以通过 old.packages() 查询是否可以找到更新的版本。

> old.packages()
         Package    LibPath                 Installed     Built    ReposVer     
survival "survival" "E:/R/Library"          "2.36-2"      "2.12.1" "2.36-5"     
lattice  "lattice"  "C:/R/R-2.12.2/library" "0.19-17"     "2.12.2" "0.19-23"    
Matrix   "Matrix"   "C:/R/R-2.12.2/library" "0.999375-46" "2.12.2" "0.999375-49"
         Repository                                                   
survival "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"
lattice  "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"
Matrix   "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"

如果这是真的，您可以使用安装新版本
install.packages("diptest")
或者只是更新所有这些，使用

update.packages()

HTH