python - 如何从 Spyder (python) Anaconda 调用 R 代码？

Question

我有一个 Python 数学优化算法，每次我必须评估函数值时，我都必须调用 R 脚本，其中编写了模拟代码(基于模拟的优化)。在尝试链接这两个代码之前，我想了解如何更轻松地链接某些内容。假设我有这个小 R 脚本:

x <- c(1,2,3,4,5,6)
y <- c(2,3,4,54)
x1 <- mean(x)
y1 <- mean(y)
z <- x1 + y1
print(z)

我想从 Spyder (Anaconda) 调用它，以便 z 显示在我的控制台上。我已经阅读了有关 rpy2 库的内容，但据我了解(如果我错了，请纠正我)，我应该用 Python 编写等效的 R 代码。有谁知道更简单的方法来做到这一点？ (我无法在 R 中很好地编写代码，因此，我无法翻译我拥有的模拟代码)。如有必要，R 将安装在 Windows 环境中，如 Anaconda。先感谢您!

Answer 1

在尝试了其他几个选项之后，子流程似乎工作得足够好。您可以通过子进程从 Python 运行 R 脚本并提供函数值作为参数 (x):

def R_script_runner(x):
    import subprocess
    output=subprocess.run(
            ["your_path_to_R_source_folder/Rscript.exe",  "your_path_to_R_script/R_script.R", x], 
                                  shell=True, stdin=subprocess.PIPE,
                                  stdout=subprocess.PIPE,
                                  stderr=subprocess.PIPE).stderr 
    return output  

R 脚本将执行其应该执行的操作。函数返回的输出主要用于调试目的，因此您可以打印它或以其他方式进行评估..