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我正在尝试使用 dask.distributed
根据多个 CSV 文件的内容同时更新 Postgresql 数据库。理想情况下,我们将 CSV 文件分发给 N 个工作人员,每个工作人员会将 CSV 文件内容插入数据库。但是,在将任务分配给工作人员时使用 Client.map()
时,我们会遇到 Cannot pickle files that notopened for read
异常。
这是代码的精简版本:
def _work(csv_path):
db = Database() # encapsulates interaction w/ postgresql database
db.open()
count = 0
with csv_path.open('r') as csv_file:
reader = csv.DictReader(csv_file)
for record in reader:
db.insert(record)
count += 1
db.close()
return count
client = Client(processes=False)
csv_files = Path('/data/files/').glob('*.csv')
csv_futures = client.map(_work, csv_files) # error occurs here
for finished in as_completed(csv_futures):
count = finished.result()
print(count)
根据相关的stackoverflow和github问题,我成功使用cloudpickle
对函数和参数进行序列化和反序列化。
cloudpickle.loads(cloudpickle.dumps(_work))
Out[69]: <function _work(csv_path)>
和
files = list(Path('/data/files/').glob('*.csv'))
files
Out[73]:
[PosixPath('/data/files/208.csv'),
PosixPath('/data/files/332.csv'),
PosixPath('/data/files/125.csv'),
PosixPath('/data/files/8.csv')]
cloudpickle.loads(cloudpickle.dumps(files))
Out[74]:
[PosixPath('/data/files/208.csv'),
PosixPath('/data/files/332.csv'),
PosixPath('/data/files/125.csv'),
PosixPath('/data/files/8.csv')]
所以,问题出在其他地方。
最佳答案
确切的异常(exception)是这样的:
File "/Users/may/anaconda/envs/eagle-i/lib/python3.6/site-packages/cloudpickle/cloudpickle.py", line 841, in save_file
raise pickle.PicklingError("Cannot pickle files that are not opened for reading: %s" % obj.mode)
_pickle.PicklingError: Cannot pickle files that are not opened for reading: a
单步执行调试器,我很好奇 obj
是什么?是,这是这样的:
<_io.TextIOWrapper name='/tmp/logs/ei_sched.log' mode='a' encoding='UTF-8'>
在上面给出的示例代码片段中,我省略了对记录器的调用,cloudpickle
就是这样的。正在提示。在尝试使用 dask 并行化此功能之前,日志记录是此功能的剩余工件。一旦我从传递给 Client.map()
的函数中删除了日志记录调用, ,事情按预期进行。
顺便说一句,这是 cloudpickle
的一个很好的收获。因为日志记录到单个文件不应该由 dask 工作人员完成。
关于python - "Cannot pickle files that are not opened for reading"使用 Client.map(),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/55637004/
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