r - 转置数据框

Question

我正在尝试在 R 中转置数据帧，但运气不佳。

数据框包含一个表观遗传数据集，第一列中有 300,000 多个 CpG 位点。 74 个额外的列被分成对照组和实验组(癌症 = 69，正常 = 5)。

我已将数据框转换为矩阵，以便可以转置数据并将其转换回数值。但是，每次我尝试将数据转换回数据框时，它最终都会变成一个列表。

我正在尝试执行以下操作:

将第一列设为标题。

将标题的名称设为第一列中的值(我想删除的 X 除外)。

data[1:10, 1:10]

    X Tumor.33 Normal.01 Tumor.01 Tumor.34 Tumor.35 Tumor.02 Tumor.03


cg00000029  0.29224   0.32605  0.58762  0.32397  0.23482  0.24012  0.22941

cg00000108  0.91243   0.89785  0.92337  0.90080  0.91220  0.92256  0.92709

cg00000109  0.77676   0.73910  0.81545  0.73603  0.76276  0.85808  0.85142

cg00000165  0.34261   0.30960  0.56392  0.32363  0.33980  0.61755  0.70855

cg00000236  0.84688   0.80654  0.84423  0.80935  0.85600  0.87766  0.83509

cg00000289  0.61535   0.60874  0.62496  0.66421  0.60556  0.66824  0.65243

cg00000292  0.72491   0.63333  0.55031  0.69690  0.73547  0.71826  0.62223

cg00000321  0.31650   0.29422  0.37737  0.28428  0.28417  0.70437  0.34829

cg00000363  0.26309   0.31460  0.29135  0.26339  0.20117  0.60604  0.60548

cg00000622  0.03325   0.02190  0.03293  0.04032  0.02815  0.03494  0.04126

Answer 1

使用 t() 函数转置矩阵或数据框。在后一种情况下，行名称成为变量(列)名称。

df > data[1:10, 1:10]

t(df)

来源: https://www.r-statistics.com/tag/transpose/