r - 在 dplyr 中使用 approx

Question

我正在尝试对每个 id 进行线性近似在 year 之间的数据框中使用点 x . dplyr似乎是一个合适的选择，但由于错误，我无法让它工作:

Error: incompatible size (9), expecting 3 (the group size) or 1

示例代码:

library(dplyr)
dat <- data.frame(id = c(1,1,1,2,2,2,3,3,3), year = c(1,2,3,1,2,3,1,2,3), x = c(1,NA,2, 3, NA, 4, 5, NA, 6))

# Linear Interpolation
dat %>% 
  group_by(id) %>% 
  mutate(x2 = as.numeric(unlist(approx(x = dat$year, y = dat$x, xout = dat$x)[2])))

样本数据:

  id year  x
1  1    1  1
2  1    2 NA
3  1    3  2
4  2    1  3
5  2    2 NA
6  2    3  4
7  3    1  5
8  3    2 NA
9  3    3  6

Answer 1

这里有几种方法(从评论中转移):

1) na.approx/ave

library(zoo)

transform(dat, x2 = ave(x, id, FUN = na.approx))

由于年份为 1、2、3，我们不需要指定它，但如果需要，则:

nr <- nrow(dat)
transform(dat, x2 = ave(1:nr, id, FUN = function(i) with(dat[i, ], na.approx(x, year))))

2) na.approx/dplyr

library(dplyr)
library(zoo)

dat %>% 
    group_by(id) %>% 
        mutate(x2 = na.approx(x, year)) %>% 
    ungroup()

如果不需要年份，则省略 na.approx 的第二个参数.

注: zoo还有其他的NA填充功能，特别是 na.spline和 na.locf .