python - 如何合并保存元数据的不同 matlab mat 文件以在 python 中使用？

Question

我有 1,000 多个非常长的 matlab 向量(不同长度 ~ 10^8 个样本)，代表来自不同患者和来源的数据。我希望将它们紧凑地组织在一个文件中，以便以后在python中方便地访问。我希望每个样本都能以某种方式保存附加信息(患者 ID、采样频率等)。

顺序应该是:

Hospital 1:
   Pat. 1:
      vector:sample 1
      vector:sample 2

   Pat. 2:
      vector:sample 1
      vector:sample 2


Hospital 2:
   Pat. 1:
      vector:sample 1
      vector:sample 2
    .
    .
    .

我考虑过将示例转换为 hdf5 文件类型并添加元数据，然后将多个 hdf5 文件合并到一个文件中，但我遇到了困难。

已经尝试过:

• matlab:High-level hdf5 matlab函数。
• matlab:将变量保存为 v7.3 mat(实际上是 hdf5)
• python :sidekit_io.h5merge

开放征求建议!

Answer 1

关于上面给出的格式，您可能希望将向量存储在矩阵中。对于医院患者样本:2，pat_ID:3455679，年龄:34，high_blood_Pressure:NO(0二进制)，您可以将其存储为“患者ID”，“医院号码”，“年龄”，“high_blood_Pressure”... 2,3455679,34,0,...

a = [1:10]' %vector 1
b = [1:10]' %vector 2
c = [a,b]   %matrix holding vecotrs 1 and 2