python - 如何解决IO错误: [Errno 2] No such file or directory: in Biopython?-6ren

python - 如何解决IO错误: [Errno 2] No such file or directory: in Biopython?

转载作者：行者123 更新时间：2023-12-01 06:05:48

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我正在尝试使用以下代码在 Biopython 中解析 fasta 文件。如何解决此错误？

from Bio import SeqIO
handle = open("C:/Users/Desktop/kk.fasta", "rU")



File "<pyshell#19>", line 1, in <module>
IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'kk.fasta'

我收到上述错误。但我的文件已经在那里了。我使用的是 windows7 操作系统，python 2.7 和 Biopython 1.57。如有任何建议，请。

最佳答案

尝试:

import os
print os.path.isfile(r"C:\Users\Desktop\kk.fasta")

如果输出为true，您可以尝试替换原代码中的字符串，看看是否有效。如果没有，请确保路径中没有拼写错误。

小r表示原始。它将所有 \ 转义为 \\ 以确保路径有效(\n 不会成为换行符)

关于python - 如何解决IO错误: [Errno 2] No such file or directory: in Biopython?，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/8018558/

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