python - 仅当 PyMOL 运行时才调用函数

Question

我有一个脚本可以对蛋白质执行一些计算。完成后，方法会导入 pymol 模块，并使用 pymol.cmd API 在 PyMOL session 中显示结果。该过程类似于以下内容:

def display_results(results, protein_fn):
    import pymol
    pymol.cmd.load(protein_fn)
    pymol.cmd.alter(...)
    ...

protein_fn = "1abc.ent"
results = analyze_protein(protein_fn)
display_results(results, protein_fn)

但是，我的脚本不一定需要在 PyMOL 中显示结果，并且我希望仅在安装并运行 PyMOL 时才执行此操作。

检查 PyMOL 是否已安装很容易(我可以尝试:导入 pymol)，但是有没有办法检查是否有事件的 PyMOL session 来显示结果？

Answer 1

我不是 PyMOL 的专家(从未编写过它的脚本)，但我看到两种可能的方法:

1. 做一些需要打开 PyMOL session 的琐碎事情并捕获异常(exception)情况
2. 查看进程名称(例如 os.system("ps ux |
grep -i pymol") )

第一种方法更好，第二种方法是肮脏的黑客。