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python - 在 Python 中使用 Rpy2 对具有翻转坐标的 ggplot2 条形图进行排序

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-01 05:40:33 33 4
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我在 Python 中有一个 R 数据框对象,使用 Rpy2,如下所示:

cat name num
1 a bob 1
2 b bob 2
3 a mary 3
4 b mary 4

我想将其绘制为带有翻转坐标的geom_bar,并且使条形的顺序与图例的顺序匹配(不更改图例)。在这里和其他邮件列表上已经有人问过这个问题,但我对如何将 R 订购代码转换为 rpy2 感到困惑。这是我当前的代码:

# attempting to reorder bars so that value 'a' of cat is first (in red)
# and value 'b' of cat is second (in green)
labels = tuple(["a", "b"])
labels = robj.StrVector(labels)
variable_i = r_df.names.index("cat")
r_df[variable_i] = robj.FactorVector(r_df[variable_i],
levels=labels)
r.pdf("test.pdf"))
p = ggplot2.ggplot(r_df) + \
ggplot2.geom_bar(aes_string(x="name",
y="num",
fill="cat"),
position=ggplot2.position_dodge(width=0.5)) + \
ggplot2.coord_flip()
p.plot()

这给出了一个具有正确图例的图表(“a”第一个为红色,“b”第二个为绿色),但每个条形图均按绿色/红色(“b”、“a”)的顺序显示“名称”的值。我对上一篇的印象帖子说这是因为 coord_flip() 翻转了顺序。如何更改条形顺序(不是图例顺序)以匹配当前图例,在每个躲避的条形组中首先绘制红色条形?谢谢。

编辑:*

在 rpy2 中尝试了 @joran 的解决方案:

labels = tuple(["a", "b"])
labels = robj.StrVector(labels[::-1])
variable_i = r_df.names.index("cat")
r_df[variable_i] = robj.FactorVector(r_df[variable_i],
levels=labels)
p = ggplot2.ggplot(r_df) + \
ggplot2.geom_bar(aes_string(x="name",
y="num",
fill="cat"),
stat="identity",
position=ggplot2.position_dodge()) + \
ggplot2.scale_fill_manual(values = np.array(['blue','red'])) + \
ggplot2.guides(fill=ggplot2.guide_legend(reverse=True)) + \
ggplot2.coord_flip()
p.plot()

这不起作用,因为找不到ggplot2.guides,但这仅用于设置图例。我的问题是:为什么需要 scale_fill_manual?我不想指定我自己的颜色,我想要默认的 ggplot2 颜色,但我只想将排序设置为特定方式。这是有道理的,使用coord_flip我需要反向排序,但这显然不足以重新排序条形(请参阅我的标签[::-1])独立于传奇。对此有何想法?

最佳答案

很抱歉,我的机器上没有 rpy 设置,但我能够通过此 R/ggplot2 代码得到我认为您所描述的内容:

dat$cat <- factor(dat$cat,levels = c('b','a'))

ggplot(dat,aes(x = name,y = num, fill = cat)) +
geom_bar(stat = "identity",position = "dodge") +
coord_flip() +
scale_fill_manual(values = c('blue','red')) +
guides(fill = guide_legend(reverse = TRUE))

enter image description here

基本上,我只是颠倒了因子水平,并颠倒了图例顺序。很复杂,但看起来像你所描述的那样。 (另外,您确实想要 stat = "identity",对吗?)

关于python - 在 Python 中使用 Rpy2 对具有翻转坐标的 ggplot2 条形图进行排序,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/17644471/

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