python - pytables。使用 f.get_node() 访问节点时发出警告

Question

我使用 python 和 pytables 来读取 h5 文件。

所以基本上我正在做的是:

f = t.open_file(file, mode='r')
root = f.root
obj = f.get_node(root, 'density_100m')

问题是我在访问 get_node 时收到警告:

DataTypeWarning: Unsupported type for attribute 'DIMENSION_LIST' in node 'density_100m'. Offending HDF5 class:

它正确输出节点内部的矩阵，但警告仍然存在。

这是 hdfViewer 中数据的样子:

问题出在这个 DIMENSION_LIST 上，但我不知道如何在没有警告的情况下访问此节点。

Answer 1

在不知道 DIMENSION_LIST 的实际数据类型的情况下，我的猜测是该文件不是用 PyTables 创建的，并且 DIMENSION_LIST 属性使用 PyTables 不知道的数据类型，例如 float16 或类似的数据类型。只要您不需要显式访问此属性，该警告就不是什么大问题。

根据您不显示警告的具体问题，您应该使用正常的 Python warning hooks来压制这种行为。鉴于您上面的代码，

import warnings

f = t.open_file(file, mode='r')
root = f.root

with warnings.catch_warnings():
    warnings.simplefilter("ignore")
    obj = f.get_node(root, 'density_100m')

# do stuff with obj